Создание новых лекарств – сложная мультидисциплинарная область, и процесс создания одного лекарства включает в себя огромное количество исследований. Помимо поиска правильной мишени, на которое будет воздействовать лекарство, необходимо провести полный анализ структуры, токсичности, эффективности огромного количества соединений-кандидатов.

Для сужения поиска таких соединений-кандидатов и предсказания их эффективности и безопасности все активнее используются методы компьютерного конструирования лекарств, в том числе с использованием ИИ-решений и машинного обучения. В их число входят:

• Молекулярный докинг – вычислительный метод, который имитирует связывание белка с лигандом (соединением-кандидатом);
• Дизайн соединения, основанный на структуре мишени;
• Моделирование 3D и 2D структуры белка;
• Предсказание свойств соединения-кандидата;
• Предсказание взаимодействие мишени и соединения.

Эти подходы активно применяются учеными-биоинформатиками кафедры биоинформатики Института биомедицины (МБФ) в проектах по разработке новых лекарств. Более того, на базе Пироговского Университета были созданы алгоритмы и сервисы, которые активно применяются не только в России, но и зарубежными коллегами. Например, сервис PASS Online позволяет предсказывать более 4000 видов биологической активности, включая фармакологические эффекты, токсические и побочные эффекты соединений.

Спикер: Алексей Лагунин, профессор РАН, заведующий кафедрой биоинформатики Института биомедицины (МБФ)

Контакты: lagunin_aa@rsmu.ru