Клинической базой кафедры является ГБУЗ «ГКБ им. Д.Д. Плетнёва ДЗМ». Сотрудники кафедры ведут большую лечебную и консультативную работу в пульмонологическом, аллергологическом отделении, функциональной диагностики, Московском научно-клиническом образовательном центре респираторной медицины. Клиническая база располагает самыми современными технически оснащенными диагностическими службами: биохимической, иммунологической и бактериологической лабораториями, рентгеновским и эндоскопическим отделениями, а также отделением ультразвуковой и функциональной диагностики, где проводятся спирография, диффузионный тест, бодиплетизмография, провокационные дыхательные тесты, эргоспирометрия.

Основными научными направлениями кафедры являются неинвазивная диагностика болезней респираторного тракта; внедрение новых методов диагностики болезней органов дыхания; изучение биомаркеров болезней органов дыхания; изучение факторов риска возникновения бронхолегочных заболеваний; образовательные программы для пациентов с болезнями органов дыхания; изучение факторов, влияющих на качество жизни при заболеваниях органов дыхания; реабилитационные программы в пульмонологии; оценка эффективности и безопасности новых лекарственных препаратов; таргетная терапия тяжёлой и резистентной бронхиальной астмы; оценка методов доставки лекарственных препаратов в дыхательные пути.