Кафедра психиатрии факультета усовершенствования врачей РНИМУ им. Н.И. Пирогова была создана в 1991 году, как кафедра психиатрии с курсом психофармакологии по инициативе доктора медицинских наук, профессора Александра Павловича Музыченко – известного последователя в области клинической психофармакологии (многие годы он являлся ученым секретарем Фармакологического комитета Минздрава СССР). Большой опыт в области клинической психофармакологии имели также профессор П.В. Морозов (долгие годы возглавлял Программу Всемирной организации здравоохранения по биологической психиатрии и психофармакологии), доцент А.Н. Богдан, доцент В.Н. Прокудин, и с начала своего существования кафедра сосредоточилась на данном направлении исследований. 

В конце 2000 г. к кафедре был присоединен цикл повышения квалификации по психосоматике. К коллективу кафедры присоединились профессора Ю.И. Либерман, Л.А. Подрезова и Л.М. Асанова, доцент Ю.В. Сейку, ассистенты, кандидаты медицинских наук В.П. Морозова и Е.П. Дубровская. До 1999 г. кафедра располагалась на базе Психиатрической больницы № 14, а с 2000-го – в Психиатрической больнице № 4 им. П.Б. Ганнушкина. Основным научным направлением работы кафедры были оценка спектра психотропной активности новых препаратов, поиски новых методов терапии психических заболеваний, в частности, при лечении резистентных форм шизофрении, выявление возможности использования психотропных средств в общесоматической практике, разработка методик амбулаторного лечения психически больных. На кафедре под руководством А.П. Музыченко активно проводились испытания новых лекарственных препаратов нейролептиков, антидепрессантов, транквилизаторов и ноотропов. 

После ухода из жизни профессора А.П. Музыченко в 2006 г. кафедру возглавил профессор Валерий Николаевич Краснов, директор Московского НИИ психиатрии Минздравсоцразвития России, многолетний (1995–2010) председатель Российского общества психиатров, с 2010 года – вице-президент Общества по международному сотрудничеству. В 2007 г. кафедра получила название «Кафедра психиатрии ФУВ РНИМУ им. Н.И.Пирогова», при этом круг ее научных разработок был значительно расширен. Помимо продолжающихся исследований в области клинической психофармакологии и психосоматики стали активно развиваться направления общей психопатологии, классификации психических расстройств, организации психиатрических служб, проблемы методологии и ряд клинических проблем, связанных с изучением аффективных расстройств, шизофрении, генерализованного тревожного расстройства и др. Коллектив кафедры пополнили профессор А.Е. Бобров, доктор медицинских наук Д.Ю.Вельтищев, ассистент, кандидат медицинских наук Л.А. Краснослободцева. Профессора В.Н. Краснов и П.В. Морозов приняли участие в создании Национального руководства по психиатрии (2009), профессор В.Н. Краснов опубликовал монографию, посвященную проблемам аффективной патологии (2011), Сотрудники кафедры принимают активное участие в психиатрической жизни страны и играют важную роль в научно-информационном обеспечении психиатров нашей страны. Профессор В.Н. Краснов входит в состав редколлегий ряда психиатрических журналов, профессор П.В. Морозов возглавляет «Журнал им. П.Б. Ганнушкина» (самый читаемый среди профессионалов). Он же возглавляет Комиссию РОП по работе с молодыми учеными и специалистами – за последние 3 года было проведено три Всероссийских школы молодых психиатров (В.Н. Краснов, А.Е. Бобров и П.В. Морозов среди организаторов и лекторов школ).

Высок престиж сотрудников кафедры на международной арене. Профессор В.Н. Краснов является сопредседателем Международной ассоциации психиатров Восточной Европы и Балканских стран, организатором многих международных симпозиумов. Профессор П.В. Морозов по рекомендации МИД РФ с 2006 г. представлял нашу страну в качестве эксперта в работе Комиссии по проблемам психического здоровья при Совете Европы в Страсбурге, участвовал в создании Руководства по соблюдению прав психически больных лиц. Был избран членом Правления и региональным представителем Всемирной психиатрической ассоциации по Восточной Европе, в 2012 г. был назначен представителем Европейской коллегии нейропсихофармакологов в России, а также членом Совета Европейской психиатрической ассоциации.