Кафедра клинической психологии была основана в 2003 году. Со дня ее основания, кафедрой руководил профессор, доктор психологических наук, член Российского психологического общества и Международной ассоциации клинических психологов, выпускник МГУ им. М.В. Ломоносова Юрий Владимирович Микадзе. С 2018 г. по июнь 2021 г. исполняла обязанности заведующей кафедрой доцент Иванова Елена Михайловна, кандидат психологических наук, выпускница МГУ им М.В. Ломоносова. В настоящее время кафедрой руководит профессор, доктор психологических наук Никишина Вера Борисовна.

Сотрудники кафедры активно участвуют в учебной и научной  работе института. За годы существования сотрудниками кафедры развивались следующие направления: нейропсихология и нейрореабилитация, патопсихология, психосоматика и нарушения психического развития в детском возрасте.

Профессор Ю.В. Микадзе принимал участие в совместной разработке с союзом реабилитологов России клинических рекомендаций по восстановлению психических функций при повреждениях головного мозга. Специалисты по патопсихологии профессор Е.И. Первичко и доцент Е.М. Иванова и другие вели работу по адаптации зарубежных подходов, методик и технологий, интегрируя их с уникальными отечественными разработками, адаптируя и модифицируя методы психодиагностики и психокоррекции. Доцент Н.Д. Семенова и  профессор Е.И. Первичко активно разрабатывают психосоматическое направление, которое направлено на изучение единства психического и соматического, организма и личности, когда любое патологическое явление рассматривается с учетом целостности человека в условиях болезни. Исследования по детской клинической психологии проводят профессор Л.А. Троицкая и доцент Т.Г. Горячева, охватывая психологическую (нейро- и пато-) диагностику, психологическую реабилитацию и коррекцию в детском возрасте.

Сотрудники кафедры активно участвуют в международных проектах, конгрессах,  имеют правительственные и профессиональные награды за свои достижения.