Институт анатомии и морфологии имени академика Ю.М. Лопухина создан в 2023 году в рамках реализации программы развития РНИМУ им. Н.И. Пирогова "Приоритет 2030". Институт объединяет кафедры, деятельность которых связана с изучением анатомии человека и оперативной хирургией. В состав Института входит Мультипрофильный аккредитационно-симуляционный центр, представляющий собой уникальную площадку для обучения медицинских специалистов системы здравоохранения с использованием симуляционного оборудования по программам высшего и дополнительного профессионального образования, подготовки и проведения первичной и первичной специализированной аккредитации специалистов системы здравоохранения, разработки научно-методических подходов для внедрения процедуры аккредитации специалистов здравоохранения на территории России, организация формирования оценочного инструментария для аккредитации специалистов здравоохранения, обучение членов аккредитационных комиссий, анализ и интерпретация результатов аккредитации в целях повышения качества образования и развития системы непрерывного медицинского образования.