РНИМУ им. Н.И. Пирогова - НКЦ персонализированной медицины

Научно-клинический центр персонализированной медицины

Руководитель: Ганковская Людмила Викторовна, д.м.н., профессор, заведующий кафедрой иммунологии МБФ

E-mail: lvgan@yandex.ru

Контактное лицо: Греченко Вячеслав Владимирович

Телефон: +7 (916) 828-34-69
E-mail: grechenko_v@mail.ru

Адрес: 117513, г. Москва, ул. Островитянова, д. 1, стр. 9

Услуги и регламент работы ЦКП

Основные направления исследований, проводимых в ЦКП

Исследование молекулярно-генетических механизмов системы врожденного иммунитета в норме и при социально значимых заболеваниях человека.

Перечень выполняемых услуг

Услуга	Единица измерения	Стоимость
Определение генетических полиморфизмов и оценка внутриклеточной экспрессии функциональных генов.	исследование	Расчет стоимости проводится по запросу. Стоимость зависит от объема и состава работ.
Исследование концентрации иммунопептидов (противомикробные пептиды, цитокины, иммуноглобулины и др.) в биологических жидкостях организма методом иммуноферментногого анализа	исследование	Расчет стоимости проводится по запросу. Стоимость зависит от объема и состава работ.
Определение экспрессии генов иммунологически значимых молекул (TLR1, TLR2, TLR3, TLR4, TLR6, TLR7, TLR9, TNF, TGF, IL-10, IL-18, IL-28 и другие цитокины, HBD-1, HBD-2, HNP-1, хемокины, каспазы и ингибиторы каспаз)	исследование	Расчет стоимости проводится по запросу. Стоимость зависит от объема и состава работ.
Оценка поверхностной экспрессии клеточных маркеров и рецепторов	исследование	Расчет стоимости проводится по запросу. Стоимость зависит от объема и состава работ.
Исследование фенотипа лейкоцитов периферической крови человека	образец	Расчет стоимости проводится по запросу. Стоимость зависит от объема и состава работ.
Получение и ведение клеточных культур	клеточная культура	Расчет стоимости проводится по запросу. Стоимость зависит от объема и состава работ.
Получение аутологичного препарата иммунопептидов из крови пациента (персонализированная иммунотерапия)	препарат	5000 р.
Обучение протеомным и геномным технологиям на основе Biotechnology Explorer™ Kits (Bio-Rad)	1 группа/занятие	Расчет стоимости проводится по запросу. Стоимость зависит от числа занятий, необходимых для освоения методики и числа слушателей в группе.

Научные методы и технологии ЦКП

Получение иммунокомпетентых клеток и их субпопуляций из различных биологических материалов.
Культивирование иммунокомпетентных клеток и клеточных линий (Vero, HeLa, U937, Jurkat) для изучения иммунотропных эффектов различных препаратов.
Оценка функциональной активности клеток под действием различных стимуляторов и/или фармакологических препаратов.
Иммуноферментный анализ (количественное определение белков в биологических жидкостях и супернатантах клеточных культур)
Проточная цитометрия (определение поверхностных маркеров и рецепторов)
ПЦР в режиме реального времени и цифровая ПЦР (оценка внутриклеточной экспрессии генов)
Пиросеквенирование и секвенирование (выявление генетических полиморфизмов) Персонализированная иммунотерапия

Перечень оборудования ЦКП

Название оборудования	Основные характеристики	Фирма производитель	Год выпуска	Сведения о метрологическом контроле (свидетельства о проверке, сертификаты о калибровке)
Цитофлуориметр проточный Beckman Coulter "NAVIOS"	Синий полупроводниковый диодный лазер, 488 нм, выходная мощность 22 мВт; Красный полупроводниковый диодный лазер, 638 нм, выходная мощность 25 мВт; Фиолетовый полупроводниковый диодный лазер, 405 нм, выходная мощность 40 мВт; Фильтр / синий лазер: 526 нм/40, 575 нм/30, 620 нм/30, 675 нм/20, 695 нм/30; Фильтр / красный лазер:660 нм/20, 725 нм /20, 755 LP, фиолетовый лазер: 450 нм /40, 550 нм/40; Максимальная скорость считывания: 25 000 событий/сек; Производительность: до 88 пробирок в час при скорости считывания 10 000 событий в сек; Чувствительность: 0,404-40 мкм	Beckman Coulter, США	2010	Не требуется
Анализатор иммуноферментный автоматический Adaltis "Personal Lab”	Автоматическое проведение иммуноферментного анализа. Автоматизированное раскапывание образцов и реактивов; Проведение ИФА до 2 планшет одновременно; Встроенный инкубатор планшет; Встроенный спектрофотометр; Создание произвольных протоколов проведение анализа	Adaltis, Италия	2010	Не требуется
Прибор для провеления полимеразной цепной реакции в режиме реального времени QIAGEN "Rotor-Gene Q”	Амплификатор для проведение ПЦР в режиме реального времени	QIAGEN, США	2010	Не требуется
Система для проведения цифровой ПЦР Bio-Rad QX200	Чувствительность системы: 1 копия ДНК на 100 000; Для проведения анализа не требуется использование стандартных кривых; Каналы детектирования: FAM (EvaGreen), HEX (VIC); Позволяет работать с интеркалирующим красителем EvaGreen	Bio-Rad, США	2014	Не требуется
Станция автоматическая для выделения нуклеиновых кислот и белков QIAGEN "QIAcube"	Автоматизированное выделение нуклеиновых кислот и белков	QIAGEN, США	2010	Не требуется
Анализатор генетический ABI PRISM 3500 Genetic Analyzer	Оптическая система: однолучевой лазер 505 нм; Автозагрузчик образцов: 96 луночный планшет; Возможность мультиплексного фрагментного анализа ДНК (до шести красителей)	Applied Biosystems, США	2012	Не требуется
Система генетического анализа QIAGEN "PyroMark Q24"	Возможность обнаружения единичных однонуклеотидных замен, вставок и делеций; Количественный анализ частот аллельной встречаемости и статуса метилирования; Исследование и анализ редких мутаций и сайтов метилирования. Анализ метилирования может быть совмещен с SNP типированием; Одновременное проведение генетического анализа 24 образцов меньше, чем за 15 минут	QIAGEN, США	2011	Не требуется
Мультиплексный анализатор белков Bio-Plex MAGPIX, основанный на технологии магнитных микросфер	Одновременный анализ до 37 аналитов в образце; Совместим с мультиплексными наборами Bio-Rad и Luminex	Bio-Rad, США	2013	Не требуется

Перечень методик измерений ЦКП

Метод персонифицированной иммунотерапии
Иммуноферментный анализ
Полимеразная цепная реакция с детекцией в режиме реального времени
Проточная цитофлуорометрия
Секвенирование
Получение и культивирование клеточных линий и культур

Описание методик

Сведения о выполненных работах

2016-2018 гг.

«Оценка полиморфизмов генов цитокинов (TNF-α и IL-10) и генов, отвечающих за мышечный и энергетический метаболизм у спортсменов высших достижений»
«Исследование показателей врожденного иммунитета у больных с хроническими циститами» - совместно с ФГБУ «НИИ урологии» Минздрава России.
«Поиск ассоциации полиморфных маркеров -308 G/A в гене TNFA, ARG753GLN и ARG677TRP в гене TLR2 с невынашиванием беременности инфекционного генеза» - совместно с кафедрой акушерства-гинекологии ЛФ ФГБОУ ВО РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России.
«Выявление взаимосвязи между полиморфизмами генов свертывающей системы и генов фолатного цикла с риском заболеваемости сердечнососудистыми заболеваниями» - совместно с кафедрой поликлинической терапии ЛФ ФГБОУ ВО РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России.
«Оценка мукозального иммунитета и разработка персонализированной иммунотерапии у больных хроническим пародонтитом» - совместно с ФГБУ "ЦНИИСиЧЛХ" Минздрава России.
«Исследование молекулярно-генетических механизмов врожденного иммунитета в патогенезе бронхиальной астмы у детей» - совместно с ФГАУ «НЦЗД» Минздрава России.
«Анализ экспрессии и функциональной активности Toll-подобных рецепторов у больных бронхиальной астмой» - совместно с ФГБУ ГНЦ «Институт иммунологии» ФМБА России.
«Изучение механизма действия комплекса иммунопептидов на экспрессию распознающих рецепторов врожденного иммунитета (TLR2, TLR4, TLR9) и противомикробных пептидов».
«Исследование экспрессии генов молекул врожденного иммунитета у пациентов с метаболическим синдромом» совместно с ФГБОУ ВО ЮУГМУ Минздрава России.
Анализ изменений врожденного иммунитета при применении комплекса иммунопептидов в лечении генитального герпеса.
Исследование действия комплекса иммунопептидов на показатели мукозального иммунитета у больных с хроническим циститом.

2019 г.

Договор о научно-практическом сотрудничестве Центром детской онкологии, гематологии и иммунологии Министерства здравоохранения Республики Беларусь и РДКБ ФГБОУ ВО РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России.
«Исследование факторов врожденного иммунитета в патогенезе острых нарушений мозгового кровообращения» Совместно с каф. неврологии, нейрохирургии и медицинской генетики ЛФ РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России
«Особенности врожденного иммунитета у детей с бронхиальной астмой» Диссертация на соискание ученой степени кандидата медицинских наук. Совместно с каф. факультетской педиатрии ПФ РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России
«Анализ экспрессии и функциональной активности Toll-подобных рецепторов у больных бронхиальной астмой» Диссертация на соискание ученой степени кандидата медицинских наук. Совместно с ФГБУ «ГНЦ Институт иммунологии» ФМБА России
«Оценка эффективности персонализированной иммунотерапии при хирургическом лечении пародонтита. Диссертация на соискание ученой степени кандидата медицинских наук». Совместно с ФГБОУ «Центральный научно-исследовательский институт стоматологии и челюстно-лицевой хирургии» Минздрава России
«Исследование факторов врожденного иммунитета у пациентов с переломами челюстей и больных пародонтитом (клинико-лабораторное исследование)». Диссертация на соискание ученой степени кандидата медицинских наук. Совместно с каф. челюстно-лицевой хирургии и стоматологии СФ РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России
«Выявление артериальной гипертонии у женщин репродуктивного возраста в условиях длительного психологического стресса. Диссертация на соискание ученой степени кандидата медицинских наук. Совместно с каф. поликлинической терапии ЛФ РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России

Регламент доступа и правила конкурсного отбора заявок на выполнение работ и оказание услуг

Регламент доступа к оборудованию

Проведение работ на оборудовании ЦКП возможно после заключения договора на выполнение научно-исследовательской работы (НИР) на базе ЦКП РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России. Работа по выполнению НИР осуществляется сотрудниками ЦКП в рамках сроков и объемов, согласованных в техническом задании к договору НИР, допуск третьих лиц к оборудованию осуществляется только при согласовании в техническом задании необходимости участия представителя Заказчика в выполнении НИР. При этом согласовывается также роль и ответственность представителя заказчика в выполнении соответствующего этапа работ.

Правила конкурсного отбора заявок на выполнение центром работ и оказание услуг

Отбор конкурирующих заявок проводится в зависимости от загруженности оборудования центра, а также с учетом цены, трудозатрат и сроков планируемых работ.