Кафедра была организована в 1951 г. Иваном Ивановичем Щербатовым. Целью и основной задачей создания кафедры являлось повышение уровня преподавания болезней уха, горла и носа студентам-педиатрам, интернам и ординаторам, оказание методической помощи профильным кафедрам вузов Российской Федерации в педагогической, научно-исследовательской и лечебной работе.

С момента основания кафедра является головной по детской оториноларингологии в Российской Федерации. В различные периоды на кафедре работали И.И. Щербатов, И.Л. Кручинина, С.И. Вульфсон, Н.В. Великоруссова, В.И. Смоликова, Н.М. Ахметьев, В.В. Солдатова, Е.Д. Лисицын, Ю.К. Будилов, Л.П. Вознесенская, Т.И. Гаращенко, О.В. Карнеева, А.П. Якушенкова. 

Иван Иванович Щербатов, Ирина Леонидовна Кручинина, Нина Васильевна Великоруссова и Евгений Дмитриевич Лисицын были участниками Великой Отечественной войны.

Заведующими кафедрой в разные годы были:

• с 1951 по 1973 — заслуженный деятель науки РФ, заслуженный врач РФ, д.м.н., профессор Щербатов Иван Иванович.
• с 1973 по 1985 — д.м.н., профессор Кручинина Ирина Леонидовна.
• С 1986 по 2021 — член-корреспондент Российской Академии медицинских наук, заслуженный деятель науки РФ, д.м.н., профессор Богомильский Михаил Рафаилович.
• с 2022 по настоящее время — профессор, д.м.н. Полунин Михаил Михайлович.

Кафедра успешно развивала и развивает научные направления, актуальные прежде всего для практического здравоохранения:

• хирургическое лечение врожденных пороков развития уха;
• доброкачественные опухоли головы и шеи;
• хирургическая эндоскопическая асссистенция при заболеваниях ЛОР-органов у детей;
• ранняя диагностика тугоухости у детей (в том числе грудного и раннего возраста) и подростков;
• фармакотерапия заболеваний ЛОР-органов у детей и подростков;
• нарушения голоса у детей и подростков;
• хемосенсорные нарушения у детей и подростков;
• кохлеарная имплантация (экспериментальные исследования).

В 1996 г. за разработку новых способов диагностики и лечения тугоухости М.Р. Богомильский, Я.М. Сапожников, а также М.А. Корнюшин и В.Ф. Китайгородская (Морозовская больница) удостоены премии мэрии г. Москвы. Проф. В.Р. Чистякова и Г.Л. Балясинская стали заслуженными врачами РФ. В 1997 г. зав. кафедрой М.Р. Богомильский избран членом-корреспондентом Российской Академии медицинских наук по специальности "Детская оториноларингология". В 2001 г. ему присвоено звание "Заслуженный деятель науки РФ".

При кафедре до 2025 г. успешно работала клинико-экспериментальная научно-исследовательская лаборатория патологии ЛОР-органов ЦНИЛ (зав. лабораторией д.м.н. И.В. Рахманова), которая проводила уникальные экспериментальные патофизиологические и морфологические работы на животных, а также исследования слуховой функции у детей, в том числе и новорожденных. Значительная часть научных исследований посвящена ювенильному папилломатозу, носовым кровотечениям при острых и хронических лейкозах, влиянию радиации на лимфоидно-глоточное кольцо, онкологии ЛОР-органов, аллергическим заболеваниям, слухосохраняющим операциям, наружным отитам, связи заболеваний придаточных пазух носа с болезнями бронхов и легких, иммунологическому статусу детей с рецидивирующими отитами и синуситами, рубцовым стенозам гортани и трахеи и т.д.

Более 30 лет основной клинической базой кафедры являлось ЛОР-отделение Филатовской больницы, которым заведовали Л.М. Никулина, Т.В. Тулина, Н.А. Невская, В.П. Поддубный, Л.И. Липилина.

В последующие годы и в настоящее время кафедра работает на крупнейших клинических базах г. Москвы (Морозовской, им. Г.Н. Сперанского, Российской детских больницах; НИКИ Педиатрии им. Ю.Е. Вельтищева, ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава России, ФГБУ ФНКЦ ФХМ ФМБА России) и Московской области (ГБУЗ МО «Детский научно-клинический центр им. Л.М. Рошаля»).

Результаты научно-практической деятельности кафедры отражены в руководствах и монографиях:

• «Острый средний отит у новорожденных и грудных детей». М.Р. Богомильский, Г.А. Самсыгина, В.С. Минасян.
• «Диагностика и хирургическое лечение хронических стенозов гортани у детей». М.Р. Богомильский, А.Ю. Разумовский, З.Б. Митупов.
• «Анатомия, физиология и патология органов слуха и речи». М.Р. Богомильский, О.С. Орлова.
• «Современные методы диагностики, лечения и коррекции тугоухости и глухоты у детей». Я.М. Сапожников, М.Р. Богомильский.
• «Отомикозы в детском возрасте». В.Р. Чистякова, И.В. Наумова.
• «Детская оториноларингология» в 2-х томах под ред. Богомильского М.Р., Чистяковой В.Р. "Острый тонзиллофарингит" Е.Ю. Радциг, М.Р. Богомильский, 2023
• Национальное руководство: «Болезни уха, горла и носа в детском возрасте» под ред. Богомильского М.Р., Чистяковой В.Р., научный редактор Е.Ю. Радциг, 1-е издание -2008, 2-е издание,переработанное и дополненное -2021г. ,

а также многочисленных учебных и методических пособиях.