Кафедра факультетской хирургии Института хирургии была создана в 1939 г. как филиал факультетской хирургической клиники в Голицынском корпусе 1-й Градской больницы по инициативе Александра Николаевича БАКУЛЕВА. С 1982 г. и по настоящее время кафедрой руководит академик РАН профессор Игорь Иванович ЗАТЕВАХИН. Кафедра располагает двумя клиническими базами: Клиническая больница Управления делами Президента РФ в качестве основной базы и ГКБ им. Д.Д. Плетнева (ранее — ГКБ № 57), осуществляющая лечебную деятельность и обучение ординаторов.

Кафедра ведет обучение студентов 4-го курса, осавивающих специальность "Педиатрия", по дисциплине "Факультетская хирургия", а также участвует в обучении ординаторов по специальностям "Хирургия" и "Сердечно-сосудистая хирургия".

Сотрудниками кафедры ведется активная научно-исследовательская работа по следующим направлениям сосудистой и абдоминальной хирургии:

• Хирургия брахиоцефальных артерий
  • Поиск оптимального алгоритма и сроков операции у пациетнов с перенесенными транзиторными ишемическими атаками (ТИА) и ОHМК
  • Разработка последовательности коррекции стенозов сонных артерий при мультифокальном атеросклерозе
  • Сравнение отдаленных результатов хирургического лечения пациентов с различными видами пластики сонных артерий – эверсионной, заплатой и первичным швом
  • Оптимизация выбора способа контроля за церебральным кровотоком у пациентов во время каротидной эндартерэктомии
  • Выработка показаний и разработка техники эндоваскулярных вмешательств при стенозах сонных артерий, а также при поражениях устий брахиоцефального ствола и подключичных артерий.
• Эндоваскулярная хирургия
  • Эндопротезирование аневризм брюшной аорты
  • Эндопротезирование аневризм подвздошных, бедренных артерий
  • Чрескожные эндоваскулярные операции (стентирование, баллонная ангиопластика на артериях нижних конечностей
  • Реолитическая тромбэктомия (AngiоJet)
  • Чрескожные эндоваскулярные операции (стентирование, баллонная ангиопластика) на подключичных артериях
  • Стентирование сонных артерий
  • Баллонная ангиопластика чревного ствола
  • Стентирование почечных артерий
  • ТИПС (трансъюгулярное порто-кавальное шунтирование)
• Абдоминальная хирургия
  • Хирургия желчных путей и поджелудочной железы
  • Хирургия язвенных гастро-дуоденальных кровотечений
  • Тактика лечения осложнений портальной гипертензии.

За период с 1982 г. по настоящее время сотрудниками кафедры были внедрены новые методы диагностики и лечения: компьютерная томография, ультразвуковая и биохимическая диагностика, исследование хеликобактериоза, видеоэндоскопическая и эндоваскулярная хирургия. На кафедре защищено 17 докторских и 60 кандидатских диссертации. Опубликовано 11 монографий, 22 главы в руководствах по хирургии и внутренним болезням. 7 статей в Малой медицинской энциклопедии, 47 методических рекомендаций, более 400  научных статей. Запатентовано 3 изобретения и 18 рационализаторских предложений.

В 1996 году сотрудникам клиники — профессору И.И. Затевахину, доценту А.А. Щеголеву — была вручена Премия мэрии г. Москвы за лучшую научно-исследовательскую работу в области здравоохранения.

В 2004 году  сотрудникам клиники — профессору И.И. Затевахину  и врачу Е.Г. Шепотько — была вручена  Премия г. Москвы в области медицины за разработку и внедрение новых технологий в лечений кровотечений из варикозно—расширенных вен пищевода.