Городская клиническая больница № 29 ведет свою историю с 1864 года, когда княгиня Наталья Борисовна Шаховская (урожденная княжна Святополк-Четвертинская) на берегу реки Синички, вблизи Главного военного госпиталя, основала общину сестер милосердия, которая впоследствии стала хорошо известна не только в Москве, но и по всей России. Община была названа в честь целительной иконы "Утоли моя печали", которая в течение всего времени существования общины была ее символом и покровительницей. 

Постепенно община разрасталась, для нее была дополнительно приобретена земля, отреставрирован особняк (который строился для графа Орлова вскоре пожара 1812 года), где начинает работать Попечительский совет больницы, а в 1875 году вводится в строй новое трехэтажное здание больничного корпуса, больница комплектуется соответствующим штатом и принимает первых больных. Этот год и считается официально годом основания больницы.  
В настоящее время ГКБ № 29 им. Н.Э. Баумана представляет собой одну из крупнейших в г. Москве многопрофильную высокотехнологичную клинику, оказывающую высококачественную медицинскую помощь в круглосуточном режиме. В состав клиники входят кардиологические, терапевтические, хирургические отделения, отделение урологии, травматологии, оториноларингологии, неврологическое отделение, отделения общей реанимации, нейрореанимации, кардиореанимации, родильный дом, перинатальный центр, консультативно-диагностический центр, В 2013 году произошло полное переоснащение клиники и родильного дома.

Занятия со студентами и работа прикрепленных ординаторов  проводится на клинических базах в 3-м терапевтическом отделении, 4-м терапевтическом отделении, отделении неотложной кардиологии,  2-м кардиологическом отделении, а также в отделениях общей реанимации, нейрореанимации и блоке кардиореанимации.