В 1967 году при медико-биологическом факультете 2 МОЛГМИ имени Н.И.Пирогова была организована кафедра биохимии, которая стала выпускающей. Первый выпуск специалистов, получивших квалификацию врач-биохимик, состоялся летом 1969 года. Преподавание началось с 1965 года, когда приказом по институту от 11.1965 года заведующей курсом биохимии МБФ была назначена Варвара Андреевна Северина – профессор основной кафедры биохимии, видный советский ученый, доктор медицинских наук, известная своими трудами по биохимии микроорганизмов. Она была первым и ведущим лектором, читавшим курс «Основы общей биохимии» на МБФ.

В апреле 1967 года была создана самостоятельная кафедра биологической химии. Возглавил ее профессор, д.м.н. Леонид Федорович Панченко. Ближайшим помощником Л.Ф. Панченко стала В.А. Северина. К началу 70-х годов коллектив кафедры биохимии МБФ состоял из 16 человек, в том числе 2 профессора, 2 доцента, старший преподаватель, 3 ассистента, 3 старших лаборанта и 5 технических лаборантов. На кафедре проходили обучение 9 аспирантов (1-3 годов обучения), а также прикомандировано 4 целевых аспиранта. Вместе с Л.Ф. Панченко преподавание на вновь созданной кафедре стали вести молодые энергичные сотрудники, прошедшие аспирантуру при кафедре биохимии лечебного факультета: А.И. Арчаков, В.М. Девиченский, О.Н. Любимцева, Т.В. Аленичева. Позднее присоединились выпускники кафедры биохимии МБФ А.И. Бохонько, А.Б. Капитанов, Н.С. Федотов, А.М. Олферьев, А.П. Логачев, Е.Д.Скоцеляс. Активно налаживали учебный процесс поступившие на кафедру преподаватели – Н.Н. Ивков, О.В. Добрынина, Н.Г. Шуппе, А.М. Герасимов, Ю.Н. Рунова.

В период 1970-1975 гг. на кафедре активно проходила защита кандидатских диссертаций сотрудников кафедры и аспирантов. Досрочно защитили диссертации первые аспиранты кафедры – Г.И. Бачманова и Т.В. Чернобровкина, которые успешно продолжили научные исследования в научных подразделениях института и кафедры.

В сферу научных интересов кафедры в то время входили вопросы, посвященные проблеме «Биологические мембраны»: принципиальный вклад был сделан кафедрой в отношении молекулярных механизмов повреждения и стабилизации биологических мембран митохондрий и микоплазмы. Были разработаны новые энзимологические критерии повреждения мембран и изучены изменения состояния мембран при целом ряде патологических процессов: опухолевый рост, токсические повреждения печени, голодание, экспериментальный шок, ишемия, мышечная дистрофия, гиподинамия и т.д. Важные новые результаты по строению дыхательной цепи, роли цитохромов и перекисного окисления в эндоплазматическом ретикулуме были получены лабораторией А.И. Арчакова, начавшей свою деятельность на кафедре биохимии МБФ под руководством профессора Л.Ф. Панченко.

В 1978 г. кафедру возглавил академик РАМН, профессор, д.м.н. Александр Иванович Арчаков, дважды лауреат Государственной премии. Педагогический процесс в этот период продожали вести О.В. Добрынина (с 1972 г. зав. уч. частью кафедры), Н.Н. Ивков, Ю.Н. Рунова, Е.Д. Скоцеляс, и вновь пришедшие преподаватели – Г.Ф. Жирнов, В.Л. Мигушина, В.Г. Ладыгина, В.Г.Лазаревич, В.Ю.Уваров, С.З.Шатинина, В.Б.Лисицына, А.И.Вареница, М.А.Шатская. С этого времени начался творческий расцвет кафедры по всем направлениям ее деятельности. Принципиально изменилось материально-техническое оснащение учебного процесса, обновились учебно-методические материалы в соответствии с новыми требованиями времени. Одной из первых кафедра создала компьютерный класс, который внес существенный вклад в реорганизацию учебного процесса. Разработана новая программа обучения и контроля знаний студентов с применением современной компьютерной техники и биоинформатики. Мощная компьютерная станция создана на базе научно-учебного комплекса кафедры и НИИ Биомедицинской химии  им. В.Н. Ореховича.

С 90-х годов значительно изменилось содержание учебного процесса. По инициативе зав. кафедрой А.И. Арчакова в программу биохимических дисциплин включены курсы клинической биохимии и молекулярной диагностики, компьютрного конструирования лекарств, геномики, протеомики. К проведению этих курсов подключились профессор В.В. Поройков, профессора А.С. Иванов и В.М. Говорун, в прошлом выпускники МБФ. Организации учебного процесса способствовала слаженная работа учебно-вспомогательного персонала. Большую работу по оборудованию учебных классов выполняла старший лаборант А.М. Манаева, имеющая высшее педагогическое образование и проработавшая на кафедре более 40 лет.

За время существования кафедры было подготовлено более 1000 врачей-биохимиков, многие из которых защитили на кафедре докторские (более 10) и кандидатские (более 50) диссертации. В настоящее время многие выпускники кафедры стали руководителями ведущих научных лабораторий и центров.

В XXI век кафедра биохимии вошла с важными успехами, сумев достаточно быстро перестроить процесс преподавания в соответствии с требованиями и условиями времени. Все это позволяет коллективу кафедры с уверенностью смотреть в будущее.