2024

1. Kuzikov A.V., Masamrekh R.A., Filippova T.A., Tumilovich A.M., Strushkevich N.V., Gilep A.A., Khudoklinova Y.Y., Shumyantseva V.V., Bielectrode strategy for determination of CYP2E1 catalytic activity: electrodes with bactosomes and voltammetric determination of 6-hydroxychlorzoxazone, Biomedicines, 2024, том: 12(1), стр 152 DOI: 10.3390/biomedicines12010152
2. Agafonova L.E., Zhdanov D.D., Gladilina Y.A., Shishparenok A.N., Shumyantseva V.V., Electrochemical approach for the analysis of DNA degradation in native DNA and apoptotic cells, Heliyon, 2024, том 10(3), стр E25602 DOI: 10.1016/j.heliyon.2024.e25602
3. Shumyantseva V.V., Pronina V.V., Bulko T.V., Agafonova L.E., Electroanalysis in pharmacogenomic studies: mechanisms of drug interaction with dNA, Biochemistry (Moscow), 2024, том 89(1), стр S224-S233 DOI: 10.1134/S0006297924140128
4. Filippova T.A., Masamrekh R.A., Khudoklinova Yu.Yu., Shumyantseva V.V., Kuzikov A.V., The multifaceted role of proteases and modern analytical methods for investigation of their catalytic activity, Biochimie, 2024, том: 222, стр 169-194 DOI: 10.1016/j.biochi.2024.03.006
5. Amoah A-.S., Pestov N.B., Korneenko T.V., Prokhorenko I.A., Kurakin G.F., Barlev N.A., Lipoxygenases at the intersection of infection and carcinogenesis, International Journal of Molecular Sciences, 2024, том: 25(7), стр 3961 DOI: 10.3390/ijms25073961
6. Shumyantseva V.V., Bulko T.V., Chistov A.A., Kolesanova E.F., Agafonova L.E., Pharmacogenomic studies of antiviral drug favipiravir, Pharmaceutics, 2024, том: 16(4), стр 503 DOI: 10.3390/pharmaceutics16040503
7. Shumyantseva V.V., Berezhnova A.V., Agafonova L.E., Bulko T.V., Veselovsky A.V., Electrochemical Analysis of the Interaction between DNA and Abiraterone D4A Metabolite, Journal of Analytical Chemistry, 2024, том: 79, стр 873-882 DOI:10.1134/S1061934824700254
8. Koroleva P.I., Kuzikov A.V., Gilep A.A., Bulko T.V., Shumyantseva V.V., Electrochemical Assessment of CYP3A4 Catalytic Activity in Bactosomes, BioNanoScience, 2024, том: 14, стр 2930-2939 DOI:10.1007/s12668-024-01539-1
9. Kudriavskii V.V., Goncharov A.O., Eremeev A.V., Ruchko E.S., Veselovsky V.A., Klimina K.M., Bogomazova A.N., Lagarkova M.A., Moshkovskii S.A., Kliuchnikova A.A., RNA Editing by ADAR Adenosine Deaminases in the Cell Models of CAG Repeat Expansion Diseases: Significant Effect of Differentiation from Stem Cells into Brain Organoids in the Absence of Substantial Influence of CAG Repeats on the Level of Editing, Biochemistry (Moscow), 2024, том: 89(8), стр 1474-1489 DOI:10.1134/S0006297924080078
10. Shumyantseva V.V., Bulko T.V., Presnova G.V., Grigorenko V.G., Rubtsova M.Yu., Electrochemical sensor for the detection of serine β-lactamase catalytic activity, Chimica Techno Acta, 2024, том 11(4), стр 202411407 doi:10.15826/chimtech.2024.11.4.07
11. Агафонова Л.Е., Шумянцева В.В., Ивин Ю.Ю., Пиняева А.Н., Ковпак А.А., Ишмухаметов А.А., Будник С.В., Чурюкин Р.С., Жданов Д.Д., Арчаков А.И., Электрохимическое профилирование вирусных частиц полиомиелита, инактивированных химическим способом и ионизирующим излучением, Биомедицинская химия, 2024, том 70(3), стр 161-167 DOI:10.18097/PBMC20247003161
12. Agafonova L.E., Shumyantseva V.V., Ivin Yu.Yu., Piniaeva A.N., Kovpak A.A., Ishmukhametov A.A., Budnik S.V., Churyukin R.S., Zhdanov D.D., Archakov A.I., Electrochemical profiling of poliovirus particles inactivated by chemical method and ionizing radiation, Biomeditsinskaya Khimiya, 2024, том 70(3), стр 161-167 doi:10.18097/PBMC20247003161

2023

1. Kliuchnikova A.A., Novikova S.E., Ilgisonis E.V., Kiseleva O.I., Poverennaya E.V., Zgoda V.G., Moshkovskii S.A., Poroikov V.V., Lisitsa A.V., Archakov A.I., Ponomarenko E.A., Blood Plasma Proteome: A Meta-Analysis of the Results of Protein Quantification in Human Blood by Targeted Mass Spectrometry, International Journal of Molecular Sciences, 2023, том: 24(1), стр 769 DOI:10.3390/ijms24010769
2. Shumyantseva V.V., Koroleva P.I., Bulko T.V., Shkel T.V., Gilep A.A., Veselovsky A.V., Approaches for increasing the electrocatalitic efficiency of cytochrome P450 3A4, Bioelectrochemistry, том: 149, стр 108277 DOI:10.1016/j.bioelechem.2022.108277
3. Lobas A.A., Solovyeva E.M., Levitsky L.I., Goncharov A.O., Lyssuk E.Y., Larin S.S., Moshkovskii S.A., Gorshkov M.V., Identification of alternative splicing in proteomes of human melanoma cell lines without RNA sequencing data, International Journal of Molecular Sciences, 2023, том: 24(3), стр 2466 DOI:10.3390/ijms24032466
4. Filippova T.A., Masamrekh R.A., Shumyantseva V.V., Latsis I.A., Farafonova T.E., Ilina I.Y., Kanashenko S.L., Moshkovskii S.A., Kuzikov A.V., Electrochemical biosensor for trypsin activity assay based on cleavage of immobilized tyrosine-containing peptide, Talanta, 2023, том: 257, стр 124341 DOI:10.1016/j.talanta.2023.124341
5.  Shumyantseva V.V., Bulko T.V., Agafonova L.E., Pronina V.V., Kostryukova L.V., comparative analysis of the interaction between the antiviral drug umifenovir and umifenovir encapsulated in phospholipids micelles (nanosome/umifenovir) with dsDNA as a model for pharmacogenomic analysis by electrochemical methods, Processes, 2023,  том: 11(3), стр 922 DOI:10.3390/pr11030922
6. Koroleva P.I., Gilep A.A., Kraevsky S.V., Tsybruk T.V., Shumyantseva V.V., Improving the Efficiency of Electrocatalysis of Cytochrome P450 3A4 by Modifying the Electrode with Membrane Protein Streptolysin O for Studying the Metabolic Transformations of Drugs, Biosensors, 2023, том: 13(4), стр 457 DOI:10.3390/bios13040457
7. Shumyantseva V.V., Koroleva P.I., Bulko T.V., Agafonova L.E., Alternative Electron Sources for Cytochrome P450s Catalytic Cycle: Biosensing and Biosynthetic Application, Processes, 2023, том:11(6), стр 1801 DOI: 10.3390/pr11061801
8. Pronina V.V., Kostryukova L.V., Bulko T.V., Shumyantseva V.V., Interaction of Doxorubicin Embedded into Phospholipid Nanoparticles and Targeted Peptide-Modified Phospholipid Nanoparticles with DNA, Molecules, 2023, том: 28(14), стр 531 DOI: 10.3390/molecules28145317
9. Filippova T.A., Masamrekh R.A., Shumyantseva V.V., Khudoklinova Yu.Yu., Kuzikov A.V., Voltammetric Analysis of (S)-O-Desmethylnaproxen for Determination of CYP2C9 Demethylase Activity, BioNanoScience, 2023, том: 13(3), стр 1278-1288 DOI: 10.1007/s12668-023-01159-1
10. Koroleva P.I., Bulko T.V., Agafonova L.E., Shumyantseva V.V., Catalytic and electrocatalytic mechanisms of cytochromes P450 in the development of biosensors and bioreactors, Biochemistry (Moscow), 2023, том: 88(10), стр 1645-1657 DOI: 10.1134/S0006297923100176
11. Жданов Д.Д., Ивин Ю.Ю., Шишпарёнок А.Н., Краевский С.В., Канашенко С.Л., Агафонова Л.Е., Шумянцева В.В., Гнеденко О.В., Пиняева А.Н., Ковпак А.А., Ишмухаметов А.А., Арчаков А.И., Перспективы создания вакцинных препаратов нового типа на основе псевдовирусных частиц (на примере вакцины против полиомиелита), Биомедицинская химия, 2023, том: 69(5), стр 253-280 DOI: 10.18097/PBMC20236905253
12. Куракин Г.Ф., Липоксигеназа гигантской серной бактерии: эволюционное решение для увеличения размера и сложности?, Биохимия, 2023, том 88(6), стр 1035-1039 DOI: 10.31857/S0320972523060118
13. Kurakin G., Lipoxygenase in a Giant Sulfur Bacterium: An Evolutionary Solution for Size and Complexity?, Biochemistry (Moscow), 2023, том: 88(6), стр 842-845 DOI: 10.1134/S0006297923060111

2022

1. Kuzikov A.V., Filippova T.A., Masamrekh R.A., Shumyantseva V.V., Electrochemical determination of (S)-7-hydroxywarfarin for analysis of CYP2C9 catalytic activity, Journal of Electroanalytical Chemistry, 2022, том: 904, стр 115937 DOI:10.1016/j.jelechem.2021.115937
2. Gilep A., Kuzikov A., Sushko T., Grabovec I., Masamrekh R., Sigolaeva L.V., Pergushov D.V., Schacher F.H., Strushkevich N., Shumyantseva V.V., Electrochemical characterization of mutant forms of rubredoxin B from Mycobacterium tuberculosis, Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics, 2022, том: 1870(1), стр 140734 DOI:10.1016/j.bbapap.2021.140734
3. Shumyantseva V.V., Bulko T.V., Koroleva P.I., Shikh E.V., Makhova A.A., Kisel M.S., Haidukevich I.V., Gilep A.A., Human Cytochrome P450 2C9 and Its Polymorphic Modifications: Electroanalysis, Catalytic Properties, and Approaches to the Regulation of Enzymatic Activity, Processes, 2022, том: 109(2), стр 383 DOI:10.3390/pr10020383
4. Агафонова Л.Е., Булко Т.В., Кузиков А.В., Масамрех Р.А., Шумянцева В.В., Сенсоры для анализа лекарственных препаратов, межлекарственных взаимодействий и каталитической активности ферментов, Вестник Российского государственного медицинского университета (Вестник РГМУ), 2022, том: 1, стр 43–49 DOI:10.24075/vrgmu.2022.009
5. Goncharov A.O., Shender V.O., Kuznetsova K.G., Kliuchnikova A.A., Moshkovskii S.A., Interplay between A-to-I Editing and Splicing of RNA: A Potential Point of Application for Cancer Therapy, International Journal of Molecular Sciences, 2022, том: 23(9), стр 5240 DOI:10.3390/ijms23095240
6. Nikitina A.S., Lipatova A.V., Goncharov A.O., Kliuchnikova A.A., Pyatnitskiy M.A., Kuznetsova K.G., Hamad A., Vorobyev P.O., Alekseeva O.N., Mahmoud M., Shakiba Y., Anufrieva K.S., Arapidi G.P., Ivanov M.V., Tarasova I.A., Gorshkov M.V., Chumakov P.M., Moshkovskii S.A., Multiomic Profiling Identified EGF Receptor Signaling as a Potential Inhibitor of Type I Interferon Response in Models of Oncolytic Therapy by Vesicular Stomatitis Virus, International Journal of Molecular Sciences, 2022, том: 23(9). стр 5244 DOI:10.3390/ijms23095244
7. Шумянцева В.В., Булко Т.В., Гнеденко О.В., Яблоков Е.О., Усанов С.А., Иванов А.С., Адренодоксины и их роль в системах цитохрома Р450, Биомедицинская химия, 2022, том: 689(1). Стр 47-54 DOI:10.18097/PBMC20226801047
8. Levitsky L.I., Kuznetsova K.G., Kliuchnikova A.A., Ilina I.Y., Goncharov A.O., Lobas A.A., Ivanov M.V., Lazarev V.N., Ziganshin R.H., Gorshkov M.V., Moshkovskii S.A., Validating Amino Acid Variants in Proteogenomics Using Sequence Coverage by Multiple Reads, Journal of proteome research, 2022, том: 21(6), стр 1438-1448 DOI:10.1021/acs.jproteome.2c00033
9. Масамрех Р.А., Кузиков А.В., Филиппова Т.А., Щербаков К.А., Веселовский А.В., Шумянцева В.В., Взаимодействие абиратерона и его фармакологически активного метаболита D4A с цитохромом Р450 2С9 (CYP2C9), Биомедицинская химия, 2022, том: 8(3), стр 201-211 DOI:10.18097/PBMC20226803201
10. Пронина В.В., Агафонова Л.Е., Масамрех Р.А., Кузиков А.В., Шумянцева В.В., Взаимодействие противоопухолевого препарата ацетата абиратерона с дцДНК, Biomedical Chemistry: Research and Methods, 2022, том: 5(2), стр e00174 DOI:10.18097/BMCRM00174
11. Biziaev N., Sokolova E., Yanvarev D.V., Toropygin I.Y., Shuvalov A., Egorova T., Alkalaeva E., Recognition of 3′ nucleotide context and stop codon readthrough are determined during mRNA translation elongation, Journal of Biological Chemistry, 2022, том: 298(7), стр 102133 DOI:10.1016/j.jbc.2022.102133
12. Shumyantseva V., Bulko T., Pronina V., Kanashenko S., Pokrovskaya M., Aleksandrova S., Zhdanov D., Electroenzymatic Model System for the Determination of Catalytic Activity of Erwinia carotovora L-Asparaginase, Processes, 2022, том: 10(7), стр 1313 DOI:10.3390/pr10071313
13. Kuzikov A.V., Filippova T.A., Masamrekh R.A., Shumyantseva V.V., Electroanalysis of 4′-Hydroxydiclofenac for CYP2C9 Enzymatic Assay, Electrocatalysis, 2022, том: 13, стр 630-640 DOI:10.1007/s12678-022-00753-3
14. Agafonova L., Zhdanov D., Gladilina Y., Kanashenko S., Shumyantseva V., A Pilot Study on an Electrochemical Approach for Assessing Transient DNA Transfection in Eukaryotic Cells, Journal of Electroanalytical Chemistry, 2022, том: 920, стр 116635 DOI:10.1016/j.jelechem.2022.116635
15. Kuznetsova K.G., Zvonareva S.S., Ziganshin R., Mekhova E.S., Dgebuadze P., Yen D.T.H., Nguyen T.H.T., Moshkovskii S.A., Fedosov A.E., Vexitoxins: conotoxin-like venom peptides from predatory gastropods of the genus Vexillum, Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 2022, том: 289(1980), стр 20221152 DOI:10.1098/rspb.2022.1152
16. Kuzikov A.V., Filippova T.A., Masamrekh R.A., Shumyantseva V.V., Biotransformation of phenytoin in the electrochemically-driven CYP2C19 system, Biophysical Chemistry, 2022, том: 291, стр 106894 DOI:10.1016/j.bpc.2022.106894
17. Шумянцева В.В., Пронина В.В., Алгоритмы расчёта параметров электрохимического биосенсора, Biomedical Chemistry: Research and Methods, 2022, том: 5(3), стр e00178 DOI:10.18097/BMCRM00178
18. Шумянцева В.В., Королева П.И., Гилеп А.А., Напольский К.С., Иванов Ю.Д., Канашенко С.Л., Арчаков А.И., Повышение эффективности электрокатализа цитохрома Р450 3А4 с помощью модификации электрода пространственно-упорядоченными наноструктурами на основе анодного оксида алюминия для исследования метаболических превращений лекарственных препаратов, Доклады Российской Академии наук. Науки о жизни, 2022, том: 506(1), стр 377-382 DOI:10.31857/S2686738922050298
19. Agafonova L., Tikhonova E., Sanzhakov M., Kostryukova L., Shumyantseva V., Electrochemical Studies of the Interaction of Phospholipid Nanoparticles with dsDNA, Processes, 2022, том: 10(11), стр 2324 DOI:10.3390/pr10112324
20. Shumyantseva V.V., Kuzikov A.V., Masamrekh R.A., Filippova T.A., Koroleva P.I., Agafonova L.E., Bulko T.V., Archakov A.I., Enzymology on an Electrode and in a Nanopore: Analysis Algorithms, Enzyme Kinetics, and Perspectives, BioNanoScience, 2022, том: 12, стр 1341-1355 DOI:10.1007/s12668-022-01037-2
21. Кузиков А.В., Масамрех Р.А., Филиппова Т.А., Шумянцева В.В., Электрохимический анализ метаболитов как метод определения активностицитохромов P450, Biomedical Chemistry: Research and Methods, 2022, том: 5(4), стр e00176 DOI:10.18097/BMCRM00176
22. Nasaev S.S., Kopeykina A.S., Kuznetsova K.G., Levitsky L.I., Moshkovskii S.A., Proteomic Analysis of Zebrafish Protein Recoding via mRNA Editing by ADAR Enzymes, Biochemistry (Moscow), 2022, том: 87(11), стр 1301-1309 DOI:10.1134/S0006297922110098
23. Agafonova L.E., Bulko T.V., Kuzikov A.V., Masamrekh R.A., Shumyantseva V.V., Sensors for analysis of drugs, drug-drug interactions, and catalytic activity of enzymes, Bulletin of Russian State Medical University, 2022, том 1, стр 41-46 DOI:10.24075/brsmu.2022.009

2021

1. Kuznetsova K.G., Levitsky L.I., Pyatnitskiy M.A., Ilina I.Y., Bubis J.A., Solovyeva E.M., Zgoda V.G., Gorshkov M.V., Moshkovskii S.A., Cysteine alkylation methods in shotgun proteomics and their possible effects on methionine residues, Journal of Proteomics, 2021, том 231, стр 104022 DOI:10.1016/j.jprot.2020.104022
2. Solovyeva E.M., Moshkovskii S.A., Gorshkov M.V., Identification-Free Control over the Precursor Isotopic Mass Misassignment in Orbitrap-Based Proteomics, Journal of The American Society for Mass Spectrometry, 2021, том: 32(1), стр 218–224 DOI:10.1021/jasms.0c00281
3. Sushko T., Kavaleuski A., Grabovec I., Kavaleuskay A., Vakhrameev D., Bukhdrukerch S., Marin E., Kuzikov A., Masamrekh R., Shumyantseva V., Tsumoto K., Borshchevskiy V., Gilep A., Strushkevich N., A new twist of rubredoxin function in M. tuberculosis, Bioorganic Chemistry, 2021, том: 109, стр 104721 DOI:10.1016/j.bioorg.2021.104721
4. Masamrekh R.A., Filippova T.A., Sherbakov K.A., Veselovsky A.V., Shumyantseva V.V., Kuzikov A.V., Interactions of galeterone and its 3‐keto‐Δ4 metabolite (D4G) with one of the key enzymes of corticosteroid biosynthesis – steroid 21‐monooxygenase (CYP21A2), Fundamental and Clinical Pharmacology, 2021, том: 35, стр 423-431 DOI:10.1111/fcp.12607
5. Shumyantseva V.V., Bulko T.V., Tikhonova E.G., Sanzhakov M.A., Kuzikov A.V., Masamrekh R.A., Pergushov D.V., Schacher F.H., Sigolaeva L.V., Electrochemical studies of the interaction of rifampicin and nanosome/rifampicin with dsDNA, Bioelectrochemistry, том: 140, стр 107736 DOI:10.1016/j.bioelechem.2020.107736
6. Shumyantseva V.V., Agafonova L.E., Bulko T.V., Kuzikov A.V., Masamrekh R.A., Yuan J., Pergushov D.V., Sigolaeva L.V., Electroanalysis of Biomolecules: Rational Selection of Sensor Construction, Biochemistry (Moscow), 2021, том: 86(S1), стр S140-S151 DOI:10.1134/S0006297921140108
7. Buzdin A., Tkachev V., Zolotovskaia M., Garazha A., Moshkovskii S., Borisov N., Gaifullin N., Sorokin M., Suntsova M., Using proteomic and transcriptomic data to assess activation of intracellular molecular pathways, Advances in Protein Chemistry and Structural Biology, 2021, том: 127, стр 1-53 DOI:10.1016/bs.apcsb.2021.02.005
8. Lipatova A.V., Soboleva A.V., Gorshkov V.A., Bubis J.A., Solovyeva E.M., Krasnov G.S., Kochetkov D.V., Vorobyev P.O., Ilina I.Y., Moshkovskii S.A., Kjeldsen F., Gorshkov M.V., Chumakov P.M., Tarasova I.A., Multi-Omics Analysis of Glioblastoma Cells' Sensitivity to Oncolytic Viruses, Cancers, 2021, том: 13(21), стр 5268 DOI:10.3390/cancers13215268
9. Shumyantseva V.V., Koroleva P.I., Bulko T.V., Sergeev G.V., Usanov S.A., Predicting drug-drug interactions by electrochemically driven cytochrome P450 3A4 reactions, Drug Metabolism and Personalized Therapy, 2021, том: 37(3), стр 241-248 DOI:10.1515/dmpt-2021-0116

2020

1. Buzdin A., Sorokin M., Garazha A., Glusker A., Aleshin A., Poddubskaya E., Sekacheva M., Kim E., Gaifullin N., Giese A., Seryakov A., Rumiantsev P., Moshkovskii S., Moiseev A., RNA sequencing for research and diagnostics in clinical oncology, Seminars in Cancer Biology, 2020, том: 60, стр 311-323 DOI:10.1016/j.semcancer.2019.07.010
2. Masamrekh R., Filippova T., Haurychenka Ya., Shcherbakov K., Veselovsky A., Strushkevich N., Shkel T., Gilep A., Usanov S., Shumyantseva V., Kuzikov A., Estimation of the inhibiting impact of abiraterone D4A metabolite on human steroid 21-monooxygenase (CYP21A2), Steroids, 2020, том: 154, стр 108528 DOI:10.1016/j.steroids.2019.108528
3. Kuzikov A.V., Masamrekh R.A., Filippova T.A., Haurychenka Y.I., Gilep A.A., Shkel T.V., Strushkevich N.V., Usanov S.A., Shumyantseva V.V., Electrochemical oxidation of estrogens as a method for CYP19A1 (aromatase) electrocatalytic activity determination, Electrochimica Acta, 2020, том: 333, стр 135539 DOI:10.1016/j.electacta.2019.135539
4. Masamrekh R.A., Kuzikov A.V., Haurychenka Y.I., Shcherbakov K.A., Veselovsky A.V., Filimonov D.A., Dmitriev A.V., Zavialova M.G., Gilep A.A., Shkel T.V., Strushkevich N.V., Usanov S.A., Archakov A.I., Shumyantseva V.V., In vitro interactions of abiraterone, erythromycin, and CYP3A4: implications for drug–drug interactions, Fundamental and Clinical Pharmacology, 2020, том: 34(1), стр 120-130 DOI:10.1111/fcp.12497
5. Shumyantseva V.V., Bulko T.V., Kuzikov A.V., Masamrekh R.A., Konyakhina A.Y., Romanenko I., Max J.B., Gilep A.A., Usanov S.A., Pergushov D.V., Schacher F.H., Sigolaeva L.V., All-electrochemical nanocomposite two-electrode setup for quantification of drugs and study of their electrocatalytical conversion by cytochromes P450, Electrochimica Acta, 2020, том: 336, стр 135579 DOI:10.1016/j.electacta.2019.135579
6. Кузнецова К.Г., Соловьева Е.М., Кузиков А.В., Горшков М.В., Мошковский С.А., Модификация остатков цистеина для масс-спектрометрического протеомного анализа: факты и артефакты, Биомедицинская химия, 2020, том: 66(1), стр 18-29 DOI:10.18097/PBMC20206601018
7. Кузиков А.В., Булко Т.В., Королева П.И., Масамрех Р.А., Бабкина С.С., Гилеп А.А., Шумянцева В.В., Цитохром Р450 3А4 как фермент биотрансформации лекарств: роль модификаций сенсорных систем в электрокатализе и электроанализе, Биомедицинская химия, 2020, том: 66(1), стр 64-70 DOI:10.18097/PBMC20206601064
8. Kuzikov A., Masamrekh R., Ershov P., Mezentsev Y., Ivanov A., Gilep A., Usanov S., Shumyantseva V., Interaction of Isatin with Cytochrome P450 Isoenzymes: Investigation by Means of Spectral and Electrochemical Methods The role of Isatin in Cytochromes P450 Ligand-Protein Binding Events, BioNanoScience, 2020, том: 10(1), стр 157-167 DOI:10.1007/s12668-019-00707-y
9. Masamrekh R., Filippova T., Haurychenka Y., Shcherbakov K., Veselovsky A., Strushkevich N., Shkel T., Gilep A., Usanov S., Shumyantseva V., Kuzikov A., Corrigendum to “Estimation of the inhibiting impact of abiraterone D4A metabolite on human steroid 21-monooxygenase (CYP21A2)” [Steroids 154 (2020) 108528], Steroids, 2020, том: 161, стр 108674 DOI:10.1016/j.steroids.2020.108674
10. Shumyantseva V.V., Bulko T.V., Kuzikov A.V., Masamrekh R.A., Pergushov D.V., Schacher F.H., Sigolaeva L.V., Electrochemical fingerprint of cytochrome c on a polymer/MWCNT nanocomposite electrode, Mendeleev Communications, 2020, том: 30(3), стр 299-301 DOI:10.1016/j.mencom.2020.05.012
11. Masamrekh R.A., Filippova T.A., Haurychenka Y.I., Sherbakov K.A., Veselovsky A.V., Shumyantseva V.V., Kuzikov A.V., The interactions of a number of steroid-metabolizing cytochromes P450 with abiraterone D4A metabolite: spectral analysis and molecular docking, Steroids, 2020, том: 162, стр 108693 DOI:10.1016/j.steroids.2020.108693
12. Sigolaeva L.V., Bulko T.V., Konyakhina A.Y., Kuzikov A.V., Masamrekh R.A., Max J.B., Köhler M., Schacher F.H., Pergushov D.V., Shumyantseva V.V., Rational Design of Amphiphilic Diblock Copolymer/MWCNT Surface Modifiers and Their Application for Direct Electrochemical Sensing of DNA, Polymers, 2020, том: 12(7), стр 1514 DOI:10.3390/polym12071514
13. Королева П.И., Кузиков А.В., Масамрех Р.А., Филимонов Д.А., Дмитриев А.В., Завьялова М.Г., Рыкова С.М., Ших Е.В., Махова А.А., Булко Т.В., Гилеп А.А., Шумянцева В.В., Моделирование межлекарственного взаимодействия омепразола и эритромицина с использованием цитохром Р450-зависимой системы in vitro, Биомедицинская химия, 2020, том: 66(3), стр 241-249 DOI:10.18097/PBMC20206603241
14. Шумянцева В.В., Агафонова Л.Е., Булко Т.В., Кузиков А.В., Масамрех Р.А., Подготовка электрохимических биосенсорных систем для анализа биологических объектов: обоснованный выбор модификаций рабочей поверхности электродов для проведения исследований в режиме "умный электрод", Biomedical Chemistry: Research and Methods, 2020, том: 3(1), стр e00119 DOI:10.18097/bmcrm00119
15. Kliuchnikova A.A., Goncharov A.O., Levitsky L.I., Pyatnitskiy M.A., Novikova S.E., Kuznetsova K.G., Ivanov M.V., Ilina I.Y., Farafonova T.E., Zgoda V.G., Gorshkov M.V., Moshkovskii S.A., Proteome-Wide Analysis of ADAR-Mediated Messenger RNA Editing during Fruit Fly Ontogeny, Journal of proteome research, 2020, том: 19(10), стр 4046-4060 DOI:10.1021/acs.jproteome.0c00347

2019

1. Kuzikov A., Masamrekh R., Shkel T., Strushkevich N., Gilep A., Usanov S., Archakov A., Shumyantseva V. , Assessment of electrocatalytic hydroxylase activity of cytochrome P450 3A4 (CYP3A4) by means of derivatization of 6β-hydroxycortisol by sulfuric acid for fluorimetric assay, Talanta, 2019, том: 196, стр 231-236 DOI:10.1016/j.talanta.2018.12.041
2. Tarasova I.A., Chumakov P.M., Moshkovskii S.A., Gorshkov M.V., Profiling modifications for glioblastoma proteome using ultra-tolerant database search: Are the peptide mass shifts biologically relevant or chemically induced?, Journal of Proteomics, 2019, том: 191(16) стр 16-21 DOI:10.1016/j.jprot.2018.05.010
3. Shumyantseva V.V., Makhova A.A., Shikh E.V., Bulko T.V., Kuzikov A.V., Masamrekh R.A., Shkel T., Usanov S., Gilep A., Archakov A.I., Bioelectrochemical Systems as Technologies for Studying Drug Interactions Related to Cytochrome P450, BioNanoScience, 2019, том: 9(1), стр 79-86 DOI:10.1007/s12668-018-0567-7
4. Lapa G.B., Isakova E.B., Mirchink E.B., Preobrazhenskaya M.N., Deboronation of New Clarithromycin-Benzo[c][1,2]oxaborole Conjugates, Anti-Infective Agents in Medicinal Chemistry, 2019, том: 17(2). Стр 99-104 DOI:10.2174/2211352517666181122130101
5. Lapa G.B., Lapa A.A., Synthesis and biological evaluation of new N-substituted 4-(arylmethoxy)piperidines as dopamine transporter inhibitors, Mendeleev Communications, 2019, том: 29(2), стр 203-205 DOI:10.1016/j.mencom.2019.03.030
6. Solovyeva E.M., Kopysov V.N., Pereverzev A.Y., Lobas A.A., Moshkovskii S.A., Gorshkov M.V., Boyarkin O.V., Method for Identification of Threonine Isoforms in Peptides by Ultraviolet Photofragmentation of Cold Ions, Analytical Chemistry, 2019, том: 91(10), стр 6709-6715 DOI:10.1021/acs.analchem.9b00770
7. Kuznetsova K.G., Ivanov M.V., Pyatnitskiy M.A., Levitsky L.I., Ilina I.Y., Chernobrovkin A.L., Zubarev R.A., Gorhskov M.V., Moshkovskii S.A., Brain Proteome of Drosophila melanogaster Is Enriched with Nuclear Proteins, 2019, том: 84(1). Стр 71–78 DOI:10.1134/S0006297919010097
8. Гончаров А.О., Ключникова А.А., Насаев Ш.Ш., Мошковский С.А., Редактирование РНК аденозиндезаминазами ADAR: от молекулярной пластичности белков нервной системы до патогенеза злокачественных опухолей человека, Биохимия, 2019, том: 84(8). стр 1129-1138 DOI:10.1134/S0320972519080050
9. Levitsky L.I., Kliuchnikova A.A., Kuznetsova K.G., Karpov D.S., Ivanov M.V., Pyatnitskiy M.A., Kalinina O.V., Gorshkov M.V., Moshkovskii S.A., Adenosine‐to‐Inosine RNA Editing in Mouse and Human Brain Proteomes, Proteomics, 2019, том: 19(23), стр e1900195 DOI:10.1002/pmic.201900195

2018

1. Tarasova I.A., Tereshkova A.V., Lobas A.A., Solovyeva E.V., Sidorenko A.S., Gorshkov V., Kjeldsen F., Bubis Ju.A., Ivanov M.V., Ilina I.Y., Moshkovskii S.A., Chumakov P.M., Gorshkov M.V., Comparative proteomics as a tool for identifying specific alterations within interferon response pathways in human glioblastoma multiforme cells, Oncotarget, 2018, том:9(2), стр:1785-1802   DOI:10.18632/oncotarget.22751
2. Ivanov M.V., Lobas A.A., Levitsky L.I., Moshkovskii S.A., Gorshkov M.V., Brute-Force Approach for Mass Spectrometry-Based Variant Peptide Identification in Proteogenomics without Personalized Genomic Data, Journal of The American Society for Mass Spectrometry, 2018, том:29, стр:0-0   DOI:10.1007/s13361-017-1859-9
3. Rakitov R., Moysa A.A., Kopylov A.T., Moshkovskii S.A., Peters R.S., Meusemann K., Misof B., Dietrich C.H., Johnson K.P., Podsiadlowski L., Walden K.K.O., Brochosomins and other novel proteins from brochosomes of leafhoppers (Insecta, Hemiptera, Cicadellidae), Insect Biochemistry and Molecular Biology, 2018, том:94, стр:0-0   DOI:10.1016/j.ibmb.2018.01.001
4. Shumyantseva V.V., Bulko T.V., Sigolaeva L.V., Kuzikov A.V., Pogodin P.V., Archakov A.I., Molecular imprinting coupled with electrochemical analysis for plasma samples classification in acute myocardial infarction diagnostic, Biosensors & Bioelectronics, 2018, том:99, стр:216-222   DOI:10.1016/j.bios.2017.07.026
5. Zolottsev V.A., Tkachev Y.V., Latysheva A.S., Kostin V.A., Novikov R.A., Timofeev V.P., Morozevich G.E., A.V. Kuzikov A.V., Shumyantseva V.V., Misharin A.Y., Comparison of [17(20)E]-21-norpregnene oxazolinyl and benzoxazolyl derivatives as inhibitors of CYP17A1 activity and prostate carcinoma cells growth, Steroids, 2018, том:129, стр:24-34   DOI:10.1016/j.steroids.2017.11.009
6. Masamrekh R., Kuzikov A., Veselovsky A., Toropygin I., Shkel T., Strushkevich N., Gilep A., Usanov S., Archakov A., Shumyantseva V., Interaction of 17α-hydroxylase, 17(20)-lyase (CYP17A1) inhibitors – abiraterone and galeterone – with human sterol 14α-demethylase (CYP51A1), Journal of Inorganic Biochemistry, 2018, том: 186, стр 24-33 DOI:10.1016/j.jinorgbio.2018.05.010
7. Кузиков А.В., Масамрех Р.А., Арчаков А.И., Шумянцева В.В., Методы определения функциональной активности изоферментов цитохрома P450, Биомедицинская химия, 2018, том: 64(2), стр 149-168 DOI:10.18097/PBMC20186402149
8. Костин В.А., Латышева А.С., Золотцев В.А., Ткачев Я.В., Тимофеев В.П., Кузиков А.В., Шумянцева В.В., Морозевич Г.Е., Мишарин А.Ю., Оксазолиновые производные [17(20)E]- 21-норпрегнена - ингибиторы активности СYP17A1 и пролиферации клеток карциномы простаты, Известия Академии наук. Серия химическая, 2018, том: 4, стр 682-687
9. Shumyantseva V.V., Bulko T.V., Kuzikov A.V., Masamrekh R.A., Archakov A.I., Analysis of l-tyrosine based on electrocatalytic oxidative reactions via screen-printed electrodes modified with multi-walled carbon nanotubes and nanosized titanium oxide (TiO2), Amino Acids, 2018, том: 50(7), стр 823-829 DOI:10.1007/s00726-018-2557-z
10. Шумянцева В.В., Кузиков А.В., Булко Т.В., Супрун Е.В., Сиголаева Л.В., Масамрех Р.А., Арчаков А.И., Методы электроанализа биологических молекул, Biomedical Chemistry: Research and Methods, 2018, том: 1(2). стр e00032 DOI:10.18097/bmcrm00032
11. Solovyeva E.M., Lobas A.A., Kopylov A.T., Ilina I.Y., Levitsky L.I., Moshkovskii S.A., Gorshkov M.V., FractionOptimizer: a method for optimal peptide fractionation in bottom-up proteomics, Analytical and Bioanalytical Chemistry, 2018, том: 410(16), стр 3827-3833 DOI: 10.1007/s00216-018-1054-2
12. Susorov D., Zakharov N., Shuvalova E., Ivanov A., Egorova T., Shuvalov A., Shatsky I.N., Alkalaeva E., Eukaryotic translation elongation factor 2 (eEF2) catalyzes reverse translocation of the eukaryotic ribosome, Journal of Biological Chemistry, 2018, том: 293(14), стр 5220-5229 DOI:10.1074/jbc.RA117.000761
13. Shumyantseva V.V., Kuzikov A.V., Masamrekh R.A., Bulko T.V., Archakov A.I., From electrochemistry to enzyme kinetics of cytochrome P450, Biosensors and Bioelectronics, 2018, том: 121(15), стр 192-204 DOI:10.1016/j.bios.2018.08.040
14. Kuzikov A.V., Masamrekh R.A., Archakov A.I., Shumyantseva V.V., Methods for Determination of Functional Activity of Cytochrome P450 Isoenzymes, Biochemistry (Moscow) Supplement. Series B: Biomedical Chemistry, 2018, том: 12(3), стр 220-240 DOI:10.1134/S1990750818030046
15. Kuzikov A.V., Masamrekh R.A., Shumyantseva V.V., Archakov A.I., A New Method for Quantitative Determination of Steroid Metabolites of Cytochrome P450-Dependent Reactions Using Fluorescent Spectroscopy, Doklady Biochemistry and Biophysics, 2018, том: 483(1), стр 302-305 DOI:10.1134/S1607672918060054
16. Kopylov A.T., Ponomarenko E.A., Ilgisonis E.V., Pyatnitskiy M.A., Lisitsa A.V., Poverennaya E.V., Kiseleva O.I., Farafonova T.E., Tikhonova O.V., Zavialova M.G., Novikova S.E., Moshkovskii S.A., Radko S.P., Morukov B.V., Grigoriev A.I., Paik Y.K., Salekdeh G.H., Urbani A., Zgoda V.G., Archakov A.I., 200+ Protein Concentrations in Healthy Human Blood Plasma: Targeted Quantitative SRM SIS Screening of Chromosomes 18, 13, Y and the Mitochondrial Chromosome Encoded Proteome, Journal of proteome research, 2018, том: 18(1), стр 120-129 DOI:10.1021/acs.jproteome.8b00391
17. Kuznetsova K.G., Kliuchnikova A.A., Ilina I.U., Chernobrovkin A.L., Novikova S.E., Farafonova T.E., Karpov D.S., Ivanov M.V., Goncharov A.O., Ilgisonis E.V., Voronko O.E., Nasaev S.S., Zgoda V.G., Zubarev R.A., Gorshkov M.V., Moshkovskii S.A., Proteogenomics of Adenosine-to-Inosine RNA Editing in the Fruit Fly, Journal of proteome research, 2018, том: 17(11), стр 3889-3903 DOI:10.1021/acs.jproteome.8b00553
18. Пятницкий М.А., Карпов Д.С., Мошковский С.А., Подходы к поиску критически важных генов в раковом геноме, Биомедицинская химия, 2018, том: 64(4), стр 303-314 DOI:10.18097/PBMC20186404303
19. Moshkovskii S.A., Ivanov M.V., Kuznetsova K.G., Gorshkov M.V., Identification of Single Amino Acid Substitutions in Proteogenomics, Biochemistry (Moscow), 2018, том: 83(3), стр 250-258 DOI:10.1134/S0006297918030057
20. Lobas A.A., Pyatnitskiy M.A., Chernobrovkin A.L., Ilina I.Y., Karpov D.S., Solovyeva E.M., Kuznetsova K.G., Ivanov M.V., Lyssuk E.Y., Kliuchnikova A.A., Voronko O.E., Larin S.S., Zubarev R.A., Gorshkov M.V., Moshkovskii S.A., Proteogenomics of Malignant Melanoma Cell Lines: The Effect of Stringency of Exome Data Filtering on Variant Peptide Identification in Shotgun Proteomics, Journal of proteome research, 2018, том: 17(5), стр 1801-1811 DOI:10.1021/acs.jproteome.7b00841

2017

1. Ivanov M.V., Lobas A.A., Karpov D.S., Moshkovskii S.A., Gorshkov M.V. , Comparison of false discovery rate control strategies for variant peptide identifications in shotgun proteogenomics, Journal of Proteome Research, 2017, том:16(5), стр:1936-1943   DOI:10.1021/acs.jproteome.6b01014
2. Kliuchnikova A.A., Kuznetsova K.G., Moshkovskii S.A., ADAR-mediated messenger RNA Editing: Analysis at the proteome level, Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry, 2017, том:11(1), стр:32-42   DOI:10.1134/S199075081701005X
3. Мошковский С.А., Омикс-биомаркеры и ранняя диагностика, Биомедицинская химия, 2017, том:63(5), стр:369-372   DOI:10.18097/PBMC20176305369
4. Супрун Е.В., Жаркова М.С., Веселовский А.В., Арчаков А.И., Шумянцева В.В., Электрохимическое окисление тромбина на печатных графитовых электродах, Электрохимия, 2017, том:53(1), стр:108-113   DOI:10.7868/S0424857017010145
5. Suprun E.V., Radko S.P., Khmeleva S.A., Mitkevich V.A., Archakov A.I., Makarov A.A., Shumyantseva V.V., Electrochemical oxidation of amyloid-beta peptide isoforms on carbon screen printed electrodes, Electrochemistry Communications, 2017, том:75, стр:33-37   DOI:10.1016/j.elecom.2016.12.009
6. Шумянцева В.В., Булко Т.В., Сиголаева Л.В., Кузиков А.В., Арчаков А.И., Полимерные матрицы с молекулярной памятью в качестве аффинных сорбентов для электроанализа миоглобина как кардиомаркера острого инфаркта миокарда, Журнал аналитической химии, 2017, том:72(4), стр:357-362   DOI:10.1134/S106193481704013X
7. Shumyantseva V.V., Bulko T.V., Sigolaeva L.V., Kuzikov A.V., Archakov A.I., Polymer Matrices with Molecular Memory as Affine Adsorbents for the Determination of Myoglobin as a Cardiac Marker of Acute Myocardial Infarction by Voltammetry, Journal of Analytical Chemistry, 2017, 72(4), 410-414
8. Suprun E.V., Radko S.P., Andreev E.A., Khmeleva S.A., Kozin S.A., Makarov A.A., Archakov A.I., Shumyantseva V.V., Electrochemical detection of Zn(II)- and Cu(II)-induced amyloid-beta aggregation: Quantitative aspects and application to amyloid-beta isoforms, Journal of Electroanalytical Chemistry, 2017, том:791, стр:152-158   DOI:10.1016/j.jelechem.2017.03.011
9. Suprun E.V., Radko S.P., Farafonova T.E., Mitkevich V.A., Makarov A.A., Archakov A.I., Shumyantseva V.V., Application of an Electrochemical Method to Evaluation of Amyloid-β Aggregation Inhibitors: Testing the RGKLVFFGR-NH2 Peptide Antiaggregant, Electroanalysis, 2017, том:29(12), стр:2906-2912   DOI:10.1002/elan.201700499
10. Suprun E.V., Radko S.P., FarafonovaT.E., Kozin S.A., Makarov A.A., Archakov A.I., Shumyantseva V.V., Electrochemical detection of protein post-translational modifications: Phosphorylation and nitration of amyloid-beta (1–16), Electrochimica Acta, 2017, том:258, стр:1182-1190   DOI:10.1016/j.electacta.2017.11.173
11. Mikhailova, T., Shuvalova, E., Ivanov, A., Susorov, D., Shuvalov, A., Kolosov, P.M., Alkalaeva, E., RNA helicase DDX19 stabilizes ribosomal elongation and termination complexes 2017 Nucleic Acids Research 45(3), с. 1307-1318.
12. Alkalaeva, E., Mikhailova, T. Reassigning stop codons via translation termination: How a few eukaryotes broke the dogma 2017 BioEssays 39(3),1600213
13. Lapa, G.B., Mirchink, E.P., Isakova, E.B., Preobrazhenskaya, M.N., Two approaches to the use of benzo[c][1,2]oxaboroles as active fragments for synthetic transformation of clarithromycin 2017 Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemistry 32(1), с. 452-456.

2016 

1. Kuznetsova K.G., Trufanov P.V., Moysa A.A., Pyatnitskiy M.A., Zgoda V.G., Gorshkov M.V., Moshkovskii S.A., Threonine versus isothreonine in synthetic peptides analyzed by high-resolution liquid chromatography/tandem mass spectrometry, Rapid Communications in Mass Spectrometry, 2016, том:30(11), стр:1323-1331   DOI:10.1002/rcm.7566
2. Kliuchnikova A.A., Samokhina N.I., Ilina I.Y., Karpov D.S., Pyatnitskiy M.A., Kuznetsova K.G., Toropygin I.Y., Kochergin S.A., Alekseev I.B., Zgoda V.G., Archakov A.I., Moshkovskii S.A. , Human aqueous humor proteome in cataract, glaucoma and pseudoexfoliation syndrome, Proteomics, 2016, том:16(13), стр:1938-1946   DOI:10.1002/pmic.201500423
3. Lobas A.A., Karpov D.S., Kopylov A.T., Solovyeva E.M., Ivanov M.V., Ilina I.Y., Lazarev V.N., Kuznetsova K.G., Ilgisonis E.V., Zgoda V.G., Gorshkov M.V., Moshkovskii S.A., Exome-based proteogenomics of HEK-293 human cell line: Coding genomic variants identified at the level of shotgun proteome, Proteomics, 2016, том:16(14), стр:1980-1991   DOI:10.1002/pmic.201500349
4. Poverennaya E.V., Kopylov A.T., Ponomarenko E.A., Ilgisonis E.V., Zgoda V.G., Tikhonova O.V., Novikova S.E., Farafonova T.E., Kiseleva Y.Y., Radko S.P., Vakhrushev I.V., Yarygin K.N., Moshkovskii S.A., Kiseleva O.I., Lisitsa A.V., Sokolov A.S., Mazur A.M., Prokhortchouck E.B., Skryabin K.G., Kostrjukova E.S., Tyakht A.V., Gorbachev A.Y., Ilina E.N., Govorun V.M., Archakov A.I., State of the Art on Chromosome 18-centric HPP in 2016: Transcriptome and Proteome Profiling of Liver Tissue and HepG2 Cells, Journal of Proteome Research, 2016, том:15(11), стр:4030-4038   DOI:10.1021/acs.jproteome.6b00380
5. Archakov A.I., Ipatova O.M., Lisitsa A.V., Moshkovskii S.A., Safe drugs: Myth or reality?, Herald of the Russian Academy of Sciences, 2016, том:86(6), стр:519-523   DOI:10.1134/S1019331616030138
6. Ключникова А.А., Кузнецова К.Г., Мошковский С.А., Редактирование матричной РНК аденозиндезаминазами ADAR: анализ на протеомном уровне, Биомедицинская химия, 2016, том:62(5), стр:510-519   DOI:10.18097/PBMC20166205510
7. Kopylov A.T., Ilgisonis E.V., Moysa A.A., Tikhonova O.V., Zavialova M.G., Novikova S.E., Lisitsa A.V., Ponomarenko E.A., Moshkovskii S.A., Markin A.A., Grigoriev A.I., Zgoda V.G., Archakov A.I., Targeted Quantitative Screening of Chromosome 18 Encoded Proteome in Plasma Samples of Astronaut Candidates., Journal of Proteome Research, 2016, том:15(11), стр:4039-4046   DOI:10.1021/acs.jproteome.6b00384
8. Naryzhny S.N., Zgoda V.G., Maynskova M.A., Novikova S.E., Ronzhina N.L., Vakhrushev I.V., Khryapova E.V., Lisitsa A.V., Tikhonova O.V., Ponomarenko E.A., Archakov A.I., Combination of virtual and experimental 2DE together with ESI LC-MS/MS gives a clearer view about proteomes of human cells and plasma, Electrophoresis, 2016, том:37(2), стр:302-309   DOI:10.1002/elps.201500382
9. Shumyantseva V.V., Kuzikov A.V., Masamrekh R.A., Khatri Y., Zavialova M.G., Bernhardt R., Archakov A.I., Direct electrochemistry of CYP109C1, CYP109C2 and CYP109D1 from Sorangium cellulosum So ce56, Electrochimica Acta, 2016, том:192, стр:72-79   DOI:10.1016/j.electacta.2016.01.162
10. Suprun E.V., Khmeleva S.A., Radko S.P., Kozin S.A., Archakov A.I., Shumyantseva V.V., Direct electrochemical oxidation of amyloid-β peptides via tyrosine, histidine, and methionine residues, Electrochemistry Communications, 2016, том:65, стр:53-56   DOI:10.1016/j.elecom.2016.02.004
11. Suprun E.V., Khmeleva S.A., Radko S.P., Archakov A.I., Shumyantseva V.V. , Electrochemical Analysis of Amyloid-b Domain 1-16 Isoforms and Their Complexes with Zn(II) Ions, Electrochimica Acta, 2016, том:187, стр:677-683   DOI:10.1016/j.electacta.2015.11.111
12. Стулов С.В., Дугин Н.О., Жаркова М.С., Щербинин Д.С., Кузиков А.В., Шумянцева В.В., Мишарин А.Ю., Веселовский А.В., Взаимодействие новых оксазолиновых производных 17(20)е-прегна-5,17(20)-диена с цитохромом P450 17A1, Биомедицинская химия, 2016, том:62(1), стр:38-44   DOI:10.18097/PBMC20166201038
13. Suprun E.V., Khmeleva S.A., Kiseleva Ya.Y., Radko S.P., Archakov A.I., Shumyantseva V.V., Quantitative Aspects of Electrochemical Detection of Amyloid-β Aggregation, Electroanalysis, 2016, том:28(9), стр:1977-1983   DOI:10.1002/elan.201501111
14. Kuzikov A.V., Masamrekh R.A., Khatri Y., Zavialova M.G., Bernhardt R., Archakov A.I., Shumyantseva V.V., Scrutiny of electrochemically-driven electrocatalysis of C-19 steroid 1α-hydroxylase (CYP260A1) from Sorangium cellulosum So ce56, Analytical Biochemistry, 2016, том:512, стр:28-35   DOI:10.1016/j.ab.2016.08.016
15. Шумянцева В.В., Булко Т.В., Сиголаева Л.В., Кузиков А.В., Арчаков А.И., Электроанализ миоглобина с помощью электродов, модифицированных молекулярно импринтированным поли-о-фенилендиамином и углеродными нанотрубками, Доклады Академии Наук. Биохимия и биофизика, 2016, том:468(4), стр:466-469   DOI:10.1134/S1607672916030157
16. Shumyantseva V.V., Bulko T.V., Sigolaeva L.V., Kuzikov A.V., Archakov A.I., Electroanalysis of Myoglobin Based on Electropolymerized Molecularly Imprinted Polymer Poly_o_Phenylenediamine and Carbon Nanotubes/Screen Printed Electrode, Doklady Biochemistry and Biophysics, 2016, 468(1), 213-216
17. Shumyantseva V.V., Bulko T.V., Sigolaeva L.V., Kuzikov A.V., Archakov A.I., Electrosynthesis and binding properties of molecularly imprinted poly-o-phenylenediamine for selective recognition and direct electrochemical detection of myoglobin, Biosensors & Bioelectronics, 2016, том:86, стр:330-336   DOI:10.1016/j.bios.2016.05.101
18. Shumyantseva V.V., Bulko T.V., Baychorov I.H., Archakov A.I., Molecularly Imprinted Polymers (MIP) in Electroanalysis of Proteins, Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry, 2016, том:10(2), стр:145-151   DOI:10.1134/S1990750816020104
19. Шумянцева В., Булко Т., Кузиков А., Сиголаева Л., Молекулярно-импринтированный поли-о-фенилендиамин в качестве аналога антител в электроанализе миоглобина, Аналитика, 2016, том:28(3), стр:84-89
20. Kostin V.A., Zolottsev V.A., Kuzikov A.V., Masamrekh R.A., Shumyantseva V.V., Veselovsky A.V., Stulov S.V., Novikov R.A., Timofeev V.P., Misharin A.Y., Oxazolinyl derivatives of [17(20)E]-21-norpregnene differing in the structure of A and B rings. Facile synthesis and inhibition of CYP17A1 catalytic activity, Steroids, 2016, том:115, стр:114-122   DOI:10.1016/j.steroids.2016.06.002
21. Khan R., Pal M., Kuzikov A.V., Bulko T., Suprun E.V., Shumyantseva V.V., Impedimetric immunosensor for detection of cardiovascular disorder risk biomarker, Materials Science and Engineering: C Materials for Biological Applications, 2016, том:68, стр:52-58   DOI:10.1016/j.msec.2016.05.107
22. Кузиков А.В., Булко Т.В., Масамрех Р.А., Махова А.А., Арчаков А.И., Усанов С.А., Ших Е.В., Шумянцева В.В., Анализ влияния мельдония на каталитическую активность цитохрома Р450 3А4, Вестник РГМУ, 2016, том:(6), стр:10-15
23. Voeikova T.A., Shebanova A.S., Ivanov Yu.D., Kaysheva A.L., Novikova L.M., Zhuravliova O.A., Shumyantseva V.V., Shaitan K.V., Kirpichnikov M.P., Debabov V.G., The role of proteins of the outer membrane of Shewanella oneidensis MR-1 in the formation and stabilization of silver sulfide nanoparticles, Applied Biochemistry and Microbiology, 2016, том:52(8), стр:769-775   DOI:10.1134/S0003683816080081
24. Ivanov, A., Mikhailova, T., Eliseev, B., Yeramala, L., Sokolova, E., Susorov, D., Shuvalov, A., Schaffitzel, C., Alkalaeva, E, PABP enhances release factor recruitment and stop codon recognition during translation termination, 2016 Nucleic Acids Research 44(16), с. 7766-7776
25. Bal, N.V., Susorov, D., Chesnokova, E., Kasianov, A., Mikhailova, T., Alkalaeva, E., Balaban, P.M., Kolosov, P., Upstream open reading frames located in the leader of protein kinase mζ mRNA regulate its translation 2016 Frontiers in Molecular Neuroscience 9(OCT2016), 103.
26. Lapa, G.B., Tsunoda, T., Shirasawa, S., Baryshnikova, M.A., Evseev, G.G., Afanasyeva, D.A., Chigorina, E.A., Synthesis of New Congeners of 1-methyl-3-aminoisoquinolines, Evaluation of Their Cytotoxic Activity, in Silico and in Vitro Study of Their Molecular Targets as PDE4B 2016 Chemical Biology and Drug Design 87(4), с. 575-582.

2015 

1. Chernobrovkin A.L., Kopylov A.T., Zgoda V.G., Moysa A.A., Pyatnitskiy M.A., Kuznetsova K.G., Ilina I.Y., Karpova M.A., Karpov D.S., Veselovsky A.V., Ivanov M.V., Gorshkov M.V., Archakov A.I., Moshkovskii S.A., Methionine to isothreonine conversion as a source of false discovery identifications of genetically encoded variants in proteogenomics, Journal of Proteomics, 2015, том:120, стр:169-178   DOI:10.1016/j.jprot.2015.03.003
2. Кузнецова К.Г., Казлас Е.В., Торховская Т.И., Каралкин П.А., Вахрушев И.В., Захарова Т.С., Санжаков М.А., Мошковский С.А., Ипатова О.М., Влияние доксорубицина, включенного в фосфолипидную транспортную наносистему, на протеом клеток HEPG2, Биомедицинская химия, 2015, том:61(3), стр:343-349   DOI:10.18097/PBMC20156103343
3. Belousov P.V., Bogolyubova A.V., Kim Y.S., Abrosimov A.Y., Kopylov A.T., Tvardovskiy A.A., Lanshchakov K.V., Sazykin A.Y., Dvinskikh N.Y., Bobrovskaya Ya.I., Selivanova L.S., Shilov E.S., Schwartz A.M., Shebzukhov Y.V., Severskaia N.V., Vanushko V.E., Moshkovskii S.A., Nedospasov S.A., Kuprash D.V., Serum Immunoproteomics Combined With Pathological Reassessment of Surgical Specimens Identifies TCP-1ζ Autoantibody as a Potential Biomarker in Thyroid Neoplasia, The Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism, 2015, том:100(9), стр:E1206–E1215   DOI:10.1210/jc.2014-4260
4. Polyakova A., Kuznetsova K., Moshkovskii S., Proteogenomics meets cancer immunology: mass spectrometric discovery and analysis of neoantigens, Expert Review of Proteomics, 2015, том:12(5), стр:533-541   DOI:10.1586/14789450.2015.1070100
5. Макаров О.В., Мошковский С.А., Карпова М.А., Нариманова М.Р., Перспектива нового способа своевременной диагностики рака яичников на основе использования комбинации сывороточных белков A-SAA и СА125, Акушерство и гинекология, 2015, том:(3), стр:45-54
6. Pyatnitskiy M., Karpov D., Poverennaya E., Lisitsa A., Moshkovskii S., Bringing Down Cancer Aircraft: Searching for Essential Hypomutated Proteins in Skin Melanoma, PLoS One, 2015, том:10(11), стр:e0142819   DOI:10.1371/journal.pone.0142819
7. Иванов М.В., Левицкий Л.И., Лобас А.А., Тарасова И.А., Придатченко М.Л., Згода В.Г., Мошковский С.А., Митулович Г., Горшков М.В., Идентификация пептидов в «скорострельной» протеомике методами тандемной масс-спектро метрии: сравнение поисковых алгоритмов, Масс-спектрометрия, 2015, том:12(1), стр:39-45   DOI:10.1134/S1061934815140075
8. Ivanov M.V., Levitsky L.I., Lobas AA., Tarasova I.A., Pridatchenko M.L., Zgoda V.G., Moshkovskii S.A., Mitulovic G., Gorshkov M.V., Peptide identification in “shotgun” proteomics using tandem mass spectrometry: Comparison of search engine algorithms, Journal of Analytical Chemistry, 2015, 70(14), 1614-1619
9. Krasnov G.S., Dmitriev A.A., Kudryavtseva A.V., Shargunov A.V., Karpov D.S., Uroshlev L.A., Melnikova N.V., Blinov V.M., Poverennaya E.V., Archakov A.I., Lisitsa A.V., Ponomarenko E.A., PPLine: An Automated Pipeline for SNP, SAP, and Splice Variant Detection in the Context of Proteogenomics, Journal of Proteome Research, 2015, том:14(9), стр:3729-3737   DOI:10.1021/acs.jproteome.5b00490
10. Suprun E.V., Zaryanov N.V., Radko S.P., Kulikova A.A., Kozin S.A., Makarov A.A., Archakov A.I., Shumyantseva V.V., Tyrosine Based Electrochemical Analysis of Amyloid-β Fragment (1-16) Binding to Metal(II) Ions, Electrochimica Acta, 2015, том:179, стр:93-99   DOI:10.1016/j.electacta.2015.01.066
11. Шумянцева В.В., Махова А.А., Булко Т.В., Бернхардт Р., Кузиков А.В., Ших Е.В., Кукес В.Г., Арчаков А.И., Таурин как модулятор каталитической активности цитохрома Р450 3А4, Биохимия, 2015, том:80(3), стр:439-448   DOI:10.1134/S0006297915030116
12. Shumyantseva V.V., Makhova A.A., Bulko T.V., Bernhardt R., Kuzikov A.V., Shich E.V., Kukes V.G., Archakov A.I., Taurine Modulates Catalytic Activity of Cytochrome P450 3A4, Biochemistry (Moscow), 2015, 80(3), 366-373
13. Stulov S.V., Dugin N.O., Zharkova M.S., Shcherbinin D.S., Kuzikov A.V., Shumantseva V.V., Misharin A.Yu., Veselovsky A.V., Interaction of Novel Oxazoline Derivatives of 17(20) E-pregna-5,17(20)-Diene with Cytochrome P450 17 A1, Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry, 2015, том:9(2), стр:115-121   DOI:10.1134/S1990750815020134
14. Шумянцева В.В., Булко Т.В., Супрун Е.В., Кузиков А.В., Агафонова Л.Е., Арчаков А.И., Электрохимические методы в биомедицинских исследованиях, Биомедицинская химия, 2015, том:61(2), стр:188-202   DOI:10.18097/PBMC20156102188
15. Радько С.П., Хмелёва С.А., Супрун Е.В., Козин С.А., Бодоев Н.В., Макаров А.А., Арчаков А.И., Шумянцева В.В., Физико-химические методы исследования агрегации b-амилоида, Биомедицинская химия, 2015, том:61(2), стр:203-218   DOI:10.18097/PBMC20156102203
16. Шумянцева В.В., Булко Т.В., Байчоров И.Х., Арчаков А.И., Полимерные антитела (МИП) в электроанализе белков, Биомедицинская химия, 2015, том:61(3), стр:325-331   DOI:10.18097/PBMC20156103325
17. Shumyantseva V.V., Bulko T.V., Suprun E.V., Kuzikov A.V., Agafonova L.E., Archakov A.I., Electrochemical Methods in Biomedical Studies, Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry, 2015, том:9(3), стр:228-243   DOI:10.1134/S1990750815030087
18. Shumyantseva V.V., Sigolaeva L.V., Agafonova L.E., Bulko T.V., Pergushov D.V., Schacher F.H., Archakov A.I., Facilitated biosensing via direct electron transfer of myoglobin integrated into diblock copolymer/multi-walled carbon nanotube nanocomposites, Journal of Materials Chemistry B, 2015, том:3, стр:5467-5477   DOI:10.1039/c5tb00442j
19. Shumyantseva V.V., Makhova A.A., Bulko T.V., Kuzikov A.V., Shich E.V., Electrocatalytic cycle of P450 cytochromes: the protective and stimulating roles of antioxidants, RSC Advances, 2015, том:5, стр:71306-71313   DOI:10.1039/c5ra09998f
20. Шумянцева В.В., Булко Т.В., Сиголаева Л.В., Кузиков А.В., Шатская М.А., Арчаков А.И., Электросинтез и характеристика связывающей способности молекулярно импринтированного поли-о-фенилендиамина в качестве аналога антител при электроанализе миоглобина, Доклады Академии Наук. Биохимия и биофизика, 2015, том:464(1), стр:111-114   DOI:10.7868/S086956521525026X
21. Шумянцева В.В., Шебанова А.С., Чаленко Я.М., Воейкова Т.А., Кирпичников М.П., Шайтан К.В., Дебабов В.Г., Электроанализ бактериальных клеток Shewanella oneidensis MR_1, Доклады Академии Наук. Биохимия и биофизика, 2015, том:464(5), стр:629-632   DOI:10.7868/S0869565215290277
22. Шумянцева В.В., Булко Т.В., Кузиков А.В., Кхан Р., Арчаков А.И., Разработка методов функционализации печатных электродов биосовместимыми нанокомпозитами на основе гибридных органо-неорганических материалов для использования в биосенсорном анализе, Биомедицинская химия, 2015, том:61(4), стр:474-479   DOI:10.18097/PBMC20156104474
23. Radko S.P., Khmeleva S.A., Suprun E.V., Kozin S.A., Bodoev N.V., Makarov A.A., Archakov A.I., Shumyantseva V.V., Physico-Chemical Methods for Studying Amyloid-β Aggregation, Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry, 2015, том:9(3), стр:258-274   DOI:10.1134/S1990750815030075
24. Susorov, D., Mikhailova, T., Ivanov, A., Sokolova, E., Alkalaeva, E., Stabilization of eukaryotic ribosomal termination complexes by deacylated tRNA, 2015 Nucleic Acids Research 43(6), с. 3332-3343.
25. Galvidis, I., Lapa, G., Burkin, M., Group determination of 14-membered macrolide antibiotics and azithromycin using antibodies against common epitopes 2015 Analytical Biochemistry 468, с. 75-82.

2014 

1. Гнеденко О.В., Иванов А.С., Яблоков Е.О., Усанов С.А., Муха Д.В., Сергеев Г.В., Кузиков А.В., Москалева Н.Е., Булко Т.В., Шумянцева В.В., Арчаков А.И. (2014). Protein-protein interactions of cytochromes P450 3A4 and 3A5 with their intermediate redox partners cytochromes, Биомедицинская химия, 60 (1), 17-27.
2. Шумянцева В.В., Махова А.А., Булко Т.В., Ших Е.В., Кукес В.Г., Усанов С.А., Арчаков А.И. (2014). Role of antioxidants in electro catalysis of cytochrome P450 3A4, Биомедицинская химия, 60 (2), 224-234.
3. Gnedenko O.V., Yablokov E.O., Usanov S.A., Mukha D.V., Sergeev G.V., Bulko T.V., Kuzikov A.V., Moskaleva N.E., Shumyantseva V.V., Ivanov A.S., Archakov A.I. (2014). SPR and electrochemical analyses of interactions between CYP3A4 or 3A5 and cytochrome b5, Chemical Physical Letters, 593, 40-44.
4. Gnedenko O.V., Ivanov A.S., Yablokov E.O., Usanov S.A., Mukha D. V., Sergeev G.V., Kuzikov A.V., Moskaleva N.E., Bulko T.V., Shumyantseva V.V., Archakov A.I. (2014). Protein-protein interactions in the systems of cytochromes P450 3A4 and 3A5, Biomedical Chemistry, 8 (3), 231-236.
5. Kuzikov A.V., Dugin N.O., Stulov S.V., Shcherbinin D.S., Zharkova M.S., Tkachev Y.V., Timofeev V.P., Veselovsky A.V., Shumyantseva V.V., Misharin A.Y. (2014). Novel oxazolinyl derivatives of pregna-5,17(20)-diene as 17α-hydroxylase/17,20-lyase (CYP17A1) inhibitors, Steroids, 88, 66-71.
6. Agafonova L.E., Shumyantseva V.V., Archakov A.I. (2014). Quartz Crystal Microbalance Immunoassay for the Cardiac Myoglobin Detection in the Plasma Samples, BioNanoScience, 4, 46-51.
7. Suprun E.V., Shumyantseva V.V., Archakov A.I. (2014). Protein Electrochemistry: Application in Medicine, Electrochimica Acta, 140, 72-82.
8. Agafonova L.E., Shumyantseva V.V., Archakov A.I. (2014). Quartz crystal microbalance for the cardiac markers/antibodies binding kinetic measurements in the plasma samples, Chemical Physical Letters, 604 (3), 5-9.
9. Shumyantseva V.V., Suprun E.V., Bulko T.V., Archakov A.I. (2014).  Electrochemical methods for detection of post-translational modifications of proteins, Biosensors & bioelectronics, 61, 131-139.
10. Shumyantseva V.V., Bulko T.V., Kuzikov A.V., Khan R., Archakov A.I. (2014). Development of Methods for Functionalization of Screen Printed Electrodes with Biocompatible Organic_Inorganic Hybrid Nanocomposites for Biosensing Applications, Biomedical Chemistry, 8 (3), 237-242.
11. Zgoda V.G., Sokolov A.S., Mazur A.M., Prokhortchouck E.B., Skryabin K.G., Ilina E.N., Kostrjukova E.S., Alexeev D.G., Tyakht A.V., Gorbachev A.Y., Govorun V.M., Archakov A.I. (2014). Chromosome 18 transcriptoproteome of liver tissue and HepG2 cells and targeted proteome mapping in depleted plasma: update 2013, Journal of proteome research, 13 (1), 183-190.
12. Kuznetzova K.G., Kazlas E.V., Torkhovskaya T.I., Karalkin P.A., Vachrushev I.V.,.Zakharova M.S., Sanzhakov M.A., Moshkovskii S.A., Ipatova O.M. (2014). The effect of Doxorubicin incorporated into a Phospholipid delivery nanosystem on HepG2 cell proteome, Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry, 8 (1), 77-83.
13. Сычева А.М., Кель А.Е., Николаев Е.Н., Мошковский С.А.(2014). Равный вклад скорости диффузии и скорости связывания ДНК в предполагаемое пространственное распределение транскрипционного ядерного фактора каппа-в внутри ядра клетки, Биохимия, 79 (6), 732-736.
14. F. Rechfeld, P. Gruber, J. Kirchmair, M. Boehler, N. Hauser, G. Hechenberger, D. Garczarczyk, GB Lapa, MN Preobrazhenskaya, P. Goekjian, T. Langer, and J. Hofmann. Thienoquinolines as novel disruptors of the pkcε/rack2 protein-protein interaction. Journal of Medicinal Chemistry, pages 3235–3246, 2014.
15. Лапа Г.Б., Барышникова М.А., Вартанян А.А., Сергеев Д.В., Чигорина Е.А. (2014). Синтез новых 3-аминоизохинолинов и их первичный скрининг на цитотоксичность, ингибирование миграции клеток и васкулогенной мимикрии (краткое сообщение). Российский биотерапевтический журнал, 13 (1), 104.
16. Lisitsa A., Moshkovskii S., Chernobrovkin A., Ponomarenko E., Archakov A. (2014).  Profiling proteoforms: promising follow-up of proteomics for biomarker discovery, Expert Review of Proteomics, 11 (1), 121-129. 

2013 

1. Шумянцева В.В., Булко Т.В., Супрун Е.В., Арчаков А.И. (2013). Electrochemical sensor systems based on one dimensional (1D) nanostructures for analysis of bioaffinity interactions, Биомедицинская химия, 59 (2), 209-218.
2. Шумянцева В., Ших Е., Махова А., Булко Т., Супрун Е. (2013). EFFECT OF QUDESAN ON CYTOCHROME P450 3A4: ELECTROCHEMICAL STUDY, Врач, 4, 40-44.
3. Shumyantseva V. V., Makhova A. A., Bulko T. V., Kuzikov A. V., Shich E. V., Suprun E. V., Kukes V., Usanov S., Archakov A. (2013). The dose-dependent influence of antioxidant vitamins on electrochemically-driven cytochrome P450 3A4 catalysis, Oxidants and Antioxidants in Medical Science, 2 (2), 113-117.
4. Girhard M., Kunigk E., Tihovsky S., Shumyantseva V., Urlacher V. (2013). Light-driven biocatalysis with cytochrome P450 peroxygenases, Biotechnology and Applied Biochemistry, 60 (1), 111-118.
5. Shumyantseva V.V., Makhova A.A., Bulko T.V., Shich E.V., Kukes V.G., Usanov S.A., Archakov A.I. (2013). The Effect of Antioxidants on Electrocatalytic Activity of Cytochrome P450 3A4, Biochemistry (Moscow), 7 (2), 159-163.
6. Шумянцева В.В., Булко Т.В., Супрун Е.В., Лисицына В.Б., Урлахер В. Б., Кузиков А.В., Арчаков А.И. (2013). Electrochemical Measurement of Intraprotein and Interprotein Electron Transfer, Биофизика, 58 (3), 453-460.
7. Shumkov A. A., Suprun E. V., Shatinina S. Z., Lisitsa A. V., Shumyantseva V. V., Archakov A. I. (2013). Gold and Silver Nanoparticles for Electrochemical Detection of Cardiac Troponin I based on Striping Voltammetry, BioNanoScience, 3, 216-222.
8. Suprun E.V., Zharkova M.S., Morozevich G.E., VeselovskyA.V., Shumyantseva V.V., Archakov A.I. (2013). Analysis of redox activity of proteins on the carbon screen printed electrodes, Electroanalysis, 25 (9), 2109-2116.
9. Махова А. А., Шумянцева В. В., Ших Е. В., Булко Т. В., Супрун Е. В., Кузиков А. В., Кукес В. Г., Арчаков А. И.(2013). Регуляция активности ферментов метаболизма лекарственных препаратов – цитохромов Р450 3А4 и 2С9 - биологически активными соединениями, Молекулярная медицина, 5, 49-53.
10. Агафонова Л.Е., Шумков А.А., Шумянцева В.B., Арчаков А.И. (2013). Новые подходы для определения кардиотропонина I в плазме крови, Вестник РГМУ, 2, 75-79.
11. Agafonova L., Shumyantseva V., Archakov A. (2013). Quartz crystal microbalance immunoassay for the cardiac myoglobin detection in the plasma samples, BioNanoScience, 4, 46-51.
12. Кукес В.Г., Шумянцева В.В., Булко Т.В., Арчаков А.И. (2013). Влияние антиоксидантного препарата этоксидола на электрохимическое восстановление цитохромов Р450 3А4, 2С9, 2D6, Лекарственные препараты и рациональная фармакотерапия, 3, 7-13.
13. Отделёнов В.А., Смирнов В.В., Дмитриев А.В., Поройков В.В., Шумянцева В.В., Красных Л.М., Сычёв Д.А., Кукес В.Г. (2013). Влияние этилметилгидроксипиридина малата на активность CYP3A4: комплексный подход к оценке влияния на систему биотрансформации лекарственных средств, Лекарственные препараты и рациональная фармакотерапия, 3, 30-36.
14. Отделенов В.А., Смирнов В.В., Дмитриев А.В., Поройков В.В., Шумянцева В.В., Красных Л.М., Сычев Д.А., Кукес В.Г. (2013). Влияние этилметилгидроксипиридина малата на активность CYP3A4: комплексный подход к оценке влияния на систему биотрансформации лекарственных средств, Лекарственные препараты и рациональная фармакотерапия, 3, 30-36.
15. Zgoda V. G., Kopylov A. T., Tikhonova O. V., Moisa A. A., Pyndyk N. V., Farafonova T. E., Novikova S. E., Lisitsa A. V., Ponomarenko E. A., Poverennaya E. V., Radko S. P., Khmeleva S. A., Kurbatov L. K., Filimonov A. D., Bogolyubova N. A., Ilgisonis E. V., Chernobrovkin A. L., Ivanov A. S., Medvedev A. E., Mezentsev Y. V., Moshkovskii S. A., Naryzhny S. N., Ilina E. N., Kostrjukova E. S., Alexeev D. G., Tyakht A.V., Govorun V. M., Archakov A. I. (2013). Chromosome 18 transcriptome profiling and targeted proteome mapping in depleted plasma, liver tissue and HepG2 cells, Journal of proteome research, 2013, 12 (1), 123-134,
16. Мошковский С.А., Кузнецова К.Г., Оливера Б.М. (2013). Конотоксины: от биоразнообразия брюхоногих моллюсков к разработке лекарственных средств, Биомедицинская химия, 59 (3), 267-294.
17. Lapa G.B., Bekker O.B., Mirchink E.P., Danilenko V.N., Preobrazhenskaya M.N. (2013).  Regioselective acylation of congeners of 3-amino-1h-pyrazolo[3,4-b]quinolines, their activity on bacterial serine/threonine protein kinases and in vitro antibacterial (including antimycobacterial) activity, Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemistry, 28 (5) 1088–1093.
18. Printsevskaya S.S., Reznikova M.I., Korolev A.M., Lapa G.B., Olsufyeva E.N., Preobrazhenskaya M.N., Plattner  J.J., Zhang Y.K. (2013).Synthesis and study of antibacterial activities of antibacterial glycopeptide antibiotics conjugated with benzoxaboroles, Future Medicinal Chemistry, 5 (6) 641–652.

2012 

1. Suprun E.V., Saveliev A.A., Evtugyn G.A., Lisitsa A.V., Bulko T.V., Shumyantseva V.V., Archakov A.I., (2012). Electrochemical approach for acute myocardial infarction diagnosis based on direct antibodies-free analysis of human blood plasma, Biosensors & bioelectronics, 33 (1), 158-164.
2. Chalenko Y., Shumyantseva V., Ermolaeva S., Archakov A. (2013). Electrochemistry of Escherichia coli JM109: direct electron transfer and antibiotic resistance, Biosensors & bioelectronics, 32 (1), 219-223.
3. Shumyantseva V. V., Bulko T. V., Suprun E. V., Archakov A. I.(2012). Electrochemical Sensor Systems Based on One-Dimensional (1D) Nanostructures for Analysis of Bioaffinity Interactions, Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry, 6 (2), 134–139.
4. Shumyantseva V. V., Shich E. V., Machova A. A., Bulko T. V., Kukes V. G., Sizova O. S., Ramenskaya G. V., Usanov S. A., Archakov A. I. (2012). The Influence of B group Vitamins on Monooxygenase Activity of Cytochrome P450 3A4: Pharmacokinetics and Electro Analysis of the Catalytic Properties, Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry, 6 (1), 87-93.
5. Ших  Е.В., Фомин Е.В., Шумянцева В.В., Булко Т.В. (2012). Комбинированная терапия пожилых пациентов с учётом метаболизма лекарственных средств, Клиническая геронтология, 18 (3-4), 54-58.
6. Suprun E. V., Arduini F., Moscone D., Palleschi G., Shumyantseva V. V., Archakov A. I. (2012). Direct Electrochemistry of Heme Proteins on Electrodes Modified with Didodecyldimethyl Ammonium Bromide and Carbon Black, Electroanalysis, 24 (10), 1923-1931.
7. Ivanov Y. D., Pleshakova T. O., Kozlov A.F., Malsagova K. A., Krohin N. V., Shumyantseva V. V., Shumov I.D., Popov V. P., Naumova O. V., Fomin B. I., Nasimov D.A., Aseev A. L., Archakov A. I. (2012). SOI nanowire for the high-sensitive detection of HBsAg and a-fetoprotein, Lab on a Chip, 2012, 12 (23), 5104-5111.
8. Булко Т.В., Супрун Е.В., Махова А.А. Ших Е.В., Шумянцева В.В., Кукес В.Г., Арчаков А.И. (2012). Электрокаталитический цикл цитохрома Р450 3А4: влияние витаминов-антиоксидантов, Медицинский академический журнал, 254-256.
9. Агафонова Л.Е., Лисица А.В., Шумянцева В.В., Арчаков А.И. (2012). Пьезокварцевый иммуносенсор для анализа плазмы крови пациентов, больных инфарктом миокарда, и ранней клинической диагностики, Медицинский академический журнал, 12 (4), 22-24.
10. Ponomarenko E., Poverennaya E., Pyatnitskiy M., Lisitsa A., Moshkovskii S., Ilgisonis E., Chernobrovkin A., Archakov A. (2012). Comparative Ranking of Human Chromosomes Based on Post-Genomic Data, Omics: a journal of integrative biology, 16 (11), 604-611.
11. Мошковский С.А. (2012). Почему клетки злокачественных опухолей продуцируют сыворочный амилоид А острой фазы, Биохимия, 77 (4), 433-436.
12. Шин Е.Ф., Водолажский Д.И., Голиков А.Ю., Белова Т.Н., Бойко Н.В., Зимаков Д.В., Черкасова Е.Н., Коган М.И., Чибичян М.Б., Мошковский С.А., Тарасов В.А., Матишов Д.Г. (2012). Выделение и анализ спектра изоформ плазминогена при развитии опухоли простаты человека, Биохимия, 77 (9), 1284-1291.
13. Tishchenko S., Gabdulkhakov A., Nevskaya N., Sarskikh A., Kostareva O., Nikonova E., Sycheva A., Moshkovskii S., Garber M., Nikonov S. (2012). High-resolution crystal structure of the isolated ribosomal L1 stalk, Acta Crystallographica Section D, 68 (8), 1051-1057.
14. Toropygin I.Y., Mirgorodskaya O.A., Moshkovskii S.A., Serebryakova M.V., Archakov A.I. (2012). Controlled trypsinolysis of human cancer and non-cancer sera for direct matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry, International journal of mass spectrometry, 325–327, 121-129.