Программа обучения в ординатуре состоит из трех блоков:

1 блок (первый год обучения) — дисциплины, модули (теоретическая часть обучения), проводятся теоретические занятий по основной дисциплине в форме лекций, семинаров, консультаций, практических занятий на базах кафедры поликлинической терапии л/ф. Проведение контроля качества освоения основной дисциплины  проводится проведением тестового контроля, текущих зачетов и итогового зачета

2 блок (второй год обучения) — производственная клиническая практика (проводится на клинических базах кафедры поликлинической терапии). Проводятся текущие отчеты после каждого цикла. Ординаторы регулярно посещают конгрессы, съезды, конференции.

3 блок — государственная итоговая аттестация.