ОЗВУЧИТЬ
  • ENG中文العربية
ПИРОГОВСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ
  • ENG中文العربية

Кафедра молекулярной биологии и медицинской биотехнологии МБФ

+
-

Список публикаций кафедры

2020

  • Osmak G., Baulina N., Koshkin P., Favorova O. Collapsing the list of myocardial infarction‑related differentially expressed genes into a diagnostic signature. Journal of Translational Medicine. 06.2020; 18(1):231.
  • Козин М.С., Кулакова О.Г., Киселёв И.С., Бойко А.Н., Фаворова О.О. Молекулярно-генетические основы рассеянного склероза: ассоциация вариантов митохондриального генома с первично-прогрессирующей формой заболевания. Молекулярная биология. 04.2020; 54(4):596-602.
  • Осьмак Г.Ж., Сидько А.Р., Киселев И.С., Фаворова О.О. Возрастзависимый подход к поиску генетических вариантов, связанных с риском инфаркта миокарда. Молекулярная биология. 04.2020; 54(4):699-704.
  • Mamedov A., Vorobyeva N., Filimonova I., Zakharova M., Kiselev I., Bashinskaya V., Baulina N., Boyko A., Favorov A., Kulakova O., Ziganshin R., Smirnov I., Poroshina A., Shilovskiy I., Khaitov M., Sykulev Y., Favorova O., Vlassov V., Gabibov A., Belogurov A Jr. Protective Allele for Multiple Sclerosis HLA-DRB1*01:01 Provides Kinetic Discrimination of Myelin and Exogenous Antigenic Peptides. Frontiers in Immunology. 01.2020; 10:3088.

2019

  • Царева Е.Ю., Фаворова О.О., Бойко А.Н., Кулакова О.Г. Генетические маркеры персонализированной терапии полигенных заболеваний: фармакогенетика рассеянного склероза. Молекулярная биология. 07.2019; 53(4):574-599.
  • Mamedov A.E., Zakharova M.Y., Favorova O.O., Kulakova O.G., Boyko A.N., Knorre V.D., Vorobieva N.A., Khurs E.N., Kiselev I.S., Baulina N.M., Gabibov A.G., Belogurov A.A. Loading Rate of Exogenous and Autoantigenic Determinants on Major Histocompatibility Complex Class II Mediates Resistance to Multiple Sclerosis. Doklady Biochemistry and Biophysics. 03.2019; 485(2):115–118.
  • Сапельников О.В., Куликов А.А., Фаворова О.О., Матвеева Н.А., Черкашин Д.И., Николаева О.А., Акчурин Р.С. Значение генетических, эпигенетических факторов и факторов транскрипции в фибрилляции предсердий. Рациональная фармакотерапия в кардиологии. 03.2019; 15(3):407-415.
  • Baulina N., Osmak G., Kiselev I., Popova E., Boyko A., Kulakova O., Favorova O. MiRNAs from DLK1-DIO3 Imprinted Locus at 14q32 are Associated with Multiple Sclerosis: Gender-Specific Expression and Regulation of Receptor Tyrosine Kinases Signaling. Cells. 02.2019; 8(2):E133.
  • Киселев И.С., Кулакова О.Г., Баулина Н.М., Башинская В.В., Попова Е.В., Бойко А.Н., Фаворова О.О. Вариабельность гена MIR196A2 как фактор риска развития первично-прогрессирующего рассеянного склероза. Молекулярная биология. 02.2019; 53(2):282–289.
  • Kiselev I., Bashinskaya V., Baulina N., Kozin M., Popova E., Boyko A., Favorova O., Kulakova O. Genetic differences between primary progressive and relapsing-remitting multiple sclerosis: The impact of immune-related genes variability. Multiple Sclerosis and Related Disorders. 01.2019; 29:130-136.

2018

  • Козин М.С., Кулакова О.Г., Киселёв И.С., Балановский О.П., Бойко А.Н., Фаворова О.О. Варианты митохондриального генома и риск развития рассеянного склероза у русских. Acta Naturae (русскоязычная версия). 12.2018; 10(4 (39)):118-125.
  • Осьмак Г.Ж., Матвеева Н.А., Титов Б.В., Фаворова О.О. Связь полиморфизма гена MIR196A2 с инфарктом миокарда и возможное вовлечение микроРНК miR-196a2 в сигнальные пути, участвующие в формировании патологического фенотипа. Молекулярная биология. 10.2018; 52(6):1006–1013.
  • Чихладзе Н.М., Фаворова О.О., Чазова И.Е. Семейная форма гиперальдостеронизма I типа: клиническое наблюдение и обзор литературы. Терапевтический архив. 09.2018; 90(9):115-122.
  • Baulina N., Osmak G., Kiselev I., Matveeva N., Kukava N., Shakhnovich R., Kulakova O., Favorova O. NGS-identified circulating miR-375 as a potential regulating component of myocardial infarction associated network. Journal of Molecular and Cellular Cardiology. 08.2018; 121:173-179.
  • Козин М.С., Кулакова О.Г., Фаворова О.О. Участие митохондрий в развитии нейродегенерации при рассеянном склерозе. Биохимия. 08.2018; 83(7):1002 – 1021.
  • Baulina N., Kulakova O., Kiselev I., Osmak G., Popova E., Boyko A., Favorova O. Immune-related miRNA expression patterns in peripheral blood mononuclear cells differ in multiple sclerosis relapse and remission. Journal of Neuroimmunology. 04.2018; 317:67-76.
  • Osmak G.J., Titov B.V., Matveeva N.A., Bashinskaya V.V., Shakhnovich R.M., Sukhinina T.S., Kukava N.G., Ruda M.Y., Favorova O.O. Impact of 9p21.3 region and atherosclerosis-related genes' variants on long-term recurrent hard cardiac events after a myocardial infarction. Gene. 03.2018; 647:283-288.

2017

  • Kulakova O., Bashinskaya V., Kiselev I., Baulina N., Tsareva E., Nikolaev R., Kozin M., Shchur S., Favorov A., Boyko A., Favorova O. Pharmacogenetics of glatiramer acetate therapy for multiple sclerosis: the impact of genome-wide association studies identified disease risk loci. Pharmacogenomics. 12.2017; 18(17):1563-1574.
  • Кукава Н.Г., Титов Б.В., Осьмак Г.Ж., Матвеева Н.А., Кулакова О.Г., Фаворов А.В., Шахнович Р.М., Руда М.Я., Фаворова О.О. Мультилокусный анализ генетической предрасположенности к инфаркту миокарда у русских: репликационное исследование. Acta Naturae (русскоязычная версия). 12.2017; 9(4 (35)):29-39.
  • Titov B.V., Osmak G.J., Matveeva N.A., Kukava N.G., Shakhnovich R.M., Favorov A.V., Ruda M.Y., Favorova O.O. Genetic risk factors for myocardial infarction more clearly manifest for early age of first onset. Molecular Biology Reports. 06.2017; 44(4):315–321.
  • Попова Е.В., Киселев И.С., Бойко А.Н., Сиверцева С.А., Малкова Н.А., Коробко Д.С., Спирин Н.Н., Касаткин Д.С., Караева А.В., Турова Е.Л., Спирина Н.Н., Волкова Л.И., Баулина Н.М., Башинская В.В., Кулакова О.Г., Фаворова О.О. Полиморфные варианты генов иммунного ответа как факторы риска развития первично-прогрессирующего рассеянного склероза. Журнал неврологии и психиатрии им. C.C. Корсакова. 02.2017; 117(2-2):14-21.
  • Осьмак Г.Ж., Lvovs D., Титов Б.В., Матвеева Н.А., Фаворова О.О., Фаворов А.В. Совместное влияние факторов риска на возникновение инфаркта миокарда: моделирование сочетанных эффектов носительства генетических вариантов, возраста и курения и анализ взаимодействия между ними. Биофизика. 01.2017; 62(1):144–150.

2016

  • Кулакова О.Г., Башинская В.В., Царева Е.Ю., Бойко А.Н., Фаворова О.О., Гусев Е.И. Анализ ассоциации полиморфизма генов, кодирующих рецепторы цитокинов, с клиническими характеристиками рассеянного склероза. Журнал неврологии и психиатрии им. C.C. Корсакова. 12.2016; 116(10-2):10-15.
  • Осьмак Г.Ж., Матвеева Н.А., Титов Б.В., Насибуллин Т.Р., Мустафина О.Е., Шахнович Р.М., Кукава Н.Г., Руда М.Я., Фаворова О.О. Сочетанное влияние генетических факторов, возраста и курения на риск развития инфаркта миокарда. Кардиология. 12.2016; 56(12):5-11.
  • Кулакова О.Г., Кабилов М.Р., Данилова Л.В., Попова Е.В., Батурина О.А., Царева Е.Ю., Баулина Н.М., Киселев И.С., Бойко А.Н., Фаворов А.В., Фаворова О.О., Власов В.В. Полногеномный анализ метилирования ДНК мононуклеарных клеток крови больных различными формами рассеянного склероза. Acta Naturae (русскоязычная версия). 09.2016; 8(3 (30)):113-121.
  • Баулина Н.М., Кулакова О.Г., Фаворова О.О. МикроРНК: роль в развитии аутоиммунного воспаления. Acta Naturae (русскоязычная версия). 06.2016; 8(1):23-36.
  • Титов Б.В., Матвеева Н.А., Мартынов М.Ю., Фаворова О.О. Мультилокусный анализ ассоциации полиморфных вариантов генов системы воспаления с ишемическим инсультом у русских. Молекулярная биология. 04.2016; 50(4):674-684.
  • Shepelin D., Korzinkin M., Vanyushina A., Aliper A., Borisov N., Vasilov R., Zhukov N., Sokov D., Prassolov V., Gaifullin N., Zhavoronkov A., Bhullar B., Buzdin A. Molecular pathway activation features linked with transition from normal skin to primary and metastatic melanomas in human. Oncotarget. 01.2016; 7(1):656-670.
  • Tsareva E., Kulakova O., Boyko A., Favorova O. Pharmacogenetics of multiple sclerosis: personalized therapy with immunomodulatory drugs. Pharmacogenetics and Genomics. 01.2016; 26(3):103-115.

2015

  • Bashinskaya V.V., Kulakova O.G., Boyko A.N., Favorov A.V., Favorova O.O. A review of genome-wide association studies for multiple sclerosis: classical and hypothesis-driven approaches. Human Genetics. 11.2015; 134(11):1143-1162.
  • Lill C.M., Luessi F., Alcina A., Sokolova E.A., Ugidos N., , Guillot-Noël L., Malhotra S., Reinthaler E., Schjeide B-.M.M., Mescheriakova J.Y., Mashychev A., Wohlers I., Akkad D.A., Aktas O., Alloza I., Antigüedad A., Arroyo R., Astobiza I., Blaschke P., Boyko A.N., Buttmann M., Chan A., Dörner T., Epplen J.T., Favorova O.O., Fedetz M., Fernández O., García-Martínez A., Gerdes L-.A., Graetz C., Hartung H-.P., Hoffjan S., Izquierdo G., Korobko D.S., Krone A.R., Kubisch C., Kümpfel T., Leyv L.А., Lohse P., Malkova N.A., Montalban X., Popova E.V., Rieckmann P., Rozhdestvenskii A.S., Schmied C., Smagina I.V., Tsareva E.Y., Winkelmann A., Zettl U.K., Binder H., Cournu-Rebeix I., Hintzen R., Zimprich A., Comabella M., Fontaine B., Urcelay E., Vandenbroeck K., Filipenko M., Matesanz F., Zipp F., Bertram L. Genome-wide significant association with seven novel multiple sclerosis risk loci. Journal of Medical Genetics. 11.2015; 52(12):848-855.
  • Kiselev I., Bashinskaya V., Kulakova O., Baulina N., Popova E., Boyko A., Favorova O. Variants of microRNA genes: Gender-specific associations with multiple sclerosis risk and severity. International Journal of Molecular Sciences. 06.2015; 16(8):20067-20081.
  • Bashinskaya V.V., Kulakova O.G., Kiselev I.S., Baulina N.M., Favorov A.V., Boyko A.N., Tsareva E.Yu., Favorova O.O. GWAS-identified multiple sclerosis risk loci involved in immune response: Validation in Russians. Journal of Neuroimmunology. 05.2015; 282:85-91.
  • Титов Б.В., Матвеева Н.А., Мартынов М.Ю., Фаворова О.О. Ишемический инсульт как комплексное полигенное заболевание. Молекулярная биология. 02.2015; 49(2):224-248.

    Научные исследования кафедры проводятся в области фундаментальной медицины и направлены в основном на изучение структуры и функции генома при комплексных (многофакторных) заболеваниях большой социальной значимости – рассеянном склерозе (РС) и сердечно-сосудистых заболеваниях (ССЗ).

    • Одним из основных направлений научной работы кафедры в течение многих лет является выяснение молекулярных основ генетической предрасположенности к РС и таким ССЗ как инфаркт миокарда (ИМ), инсульт, атеросклероз и артериальная гипертония. Для выявления совокупного вклада независимо действующих и/или взаимодействующих полиморфных генов в развитие этих заболеваний был разработан оригинальный статистический подход, использующий метод Монте-Карло Марковскими цепями (MCMC) и статистику Вилкоксона-Манна-Уитни. Для реализации этого подхода создано программное обеспечение APSampler, которое может использовать данные индивидуального геномного типирования десятков и сотен полиморфных участков генов-кандидатов.
    • Предложены композитные маркеры развития изучаемых заболеваний и характера их клинического течения, включающие полиморфные варианты нескольких генов. С использованием оригинального биоинформатического подхода показано, что кумулятивный эффект носительства полиморфных вариантов нескольких генов может определяться или аддитивным вкладом этих вариантов, или эпистатическими взаимодействиями между ними.
    • Показаны сходство и различия генетической природы двух основных форм РС: ремитирующей и первично-прогрессирующей. Выявлены эпистатические взаимодействия между вариантами ядерного и митохондриального геномов при РС. Фармакогенетические и фармакогеномные исследования ответа на лечение РС иммуномодулирующими препаратами позволили предложить маркеры для предпочтительного использования одного из препаратов.
    • В последние годы в исследованиях кафедры для анализа вовлеченности генома в развитие РС и ССЗ активно используются методы функциональной геномики. Гендер-специфический анализ дифференциальной экспрессии регуляторных микроРНК в мононуклеарных клетках крови больных РС и здоровых контролей с помощью высокопроизводительных методов секвенирования позволил впервые показать повышение экспрессии многих генов регуляторных микроРНК из импринтированного локуса DLK1-DIO3 на хромосоме 14, наблюдаемое только у больных ремиттирующим РС мужчин по сравнению со здоровыми мужчинами. Эти результаты были валидированы методом RT-qPCR на независимой выборке. Аналогичный подход применительно к ИМ выявил две дифференциально экспрессирующиеся микроРНК: miR-208b и miR-375 с измененными уровнями в плазме при ИМ. Обе микроРНК могут быть биомаркерами ИМ.
    • Предложен и использован применительно к дифференциально экспрессирующимся микроРНК и к микроРНК, полиморфные варианты которых ассоциированы с ИМ, метод предсказания их функциональной роли на основании биоинформатического анализа топологических характеристик сетей ген-генных взаимодействий ее непосредственных мишеней.
    • Проводится полнотранскриптомный анализ экспрессии генов при РС и ССЗ. Разработка подхода, основанного на последовательном сокращении числа выявленных дифференциально экспрессирующихся генов с помощью биоинформатических методов, открывает возможность предложить высокоэффективные композитные маркеры, основанные на оценке уровней экспрессии небольшого числа генов («транскрипционная подпись»).
    • Все большее внимание в исследованиях кафедры уделяется эпигенетическим процессам при патологических состояниях. Проведен полногеномный анализ метилирования ДНК у больных РС. Впервые показано участие этого эпигенетического механизма в формировании основных форм заболевания.
    • Разработан метод диагностики редкого моногенного ССЗ – семейного гиперальдостеронизма первого типа (глюкокортикоид-подавляемый гиперальдостеронизм). У двух больных из собранной в течение многих лет коллекции ДНК 330 больных с первичным гиперальдостеронизмом выявлено наличие химерного гена CYP11B2/CYP11B1. Для этих больных проведен семейный анализ и обнаружены родственники, являющиеся носителями химерного гена. В мире описано всего несколько десятков семей с таким генетическим дефектом.

    Среди других направлений научной работы сотрудников кафедры можно выделить

    • исследования пластичности нейральных стволовых и прогениторных клеток взрослого организма в процессах дифференцировки и пролиферации в норме и патологии (проф. Павлова Г.В.);
    • поиск и характеристика новых эпигенетических маркеров (аномальное метилирование, некодирующие РНК) для ряда злокачественных новообразований и аутоиммунных заболеваний (проф. Залетаев Д.В.);
    • анализ транскриптома в норме и при патологии сердечно-сосудистой системы, а также клонирование, изучение и модификация свойств ферментов-тромболитиков (доц. Скамров А.В).

    МЫ В СОЦСЕТЯХ

    © 2025 ФГАОУ ВО "Российский Национальный Исследовательский Медицинский Университет им. Н.И. Пирогова" Министерства здравоохранения Российской Федерации
    Российская Федерация, г. Москва 117513, ул. Островитянова д. 1
    E-mail: rsmu@rsmu.ru

    ОФИЦИАЛЬНАЯ ИНФОРМАЦИЯ


    ОБРАТНАЯ СВЯЗЬ

    На сайте использованы фотографии, приобретенные в фотобанке "Фотодженика"