Сфера научных интересов:

• организация реабилитационного процесса в травматологии и ортопедии;
• разработка программ реабилитации при патологии органов движения и опоры;
• разработка и апробация новых методов постановки реабилитационного диагноза, реабилитационных действий и реабилитационного оборудования.

Цыкунов М.Б. осуществляет руководство плановыми научно-исследовательскими темами сотрудников и диссертационными работами сотрудников и внешних соискателей по специальностям «14.01.15 Травматология и ортопедия», «14.03.11 Восстановительная медицина, спортивная медицина, лечебная физкультура, курортология и физиотерапия»; ведет научное редактирование переводов монографий, экспертную работу в комиссиях МЗ РФ по вопросам медицинской реабилитации, научное редактирование материалов для публикации в журнале «Вестник травматологии и ортопедии им. Н.Н. Приорова», подготовку и редактирование клинических рекомендаций по травматологии и ортопедии (раздел – реабилитация).

Секретарь ЦАК по медицинской реабилитации, заместитель председателя Союза реабилитологов России, ответственный секретарь редакционной коллегии журнала «Вестник травматологии и ортопедии им. Н.Н. Приорова», заместитель главного редактора журнала «Физическая и реабилитационная медицина, медицинская реабилитация», член ред. коллегии журналов «Лечебная физкультура и спортивная медицина» и «Вестник восстановительной медицины», член диссертационного совета Д 208.072.07 при РНИМУ им Н.И. Пирогова по специальности «14.03.11 ˗ Восстановительная медицина, спортивная медицина, лечебная физкультура, курортология и физиотерапия».

Награжден благодарностью министра здравоохранения России в 2017 году.