В 1978 г. избрана по конкурсу младшим научным сотрудником на кафедру акушерства и гинекологии педиатрического факультета Второго Московского ордена Ленина государственного медицинского института им. Н.И. Пирогова (ныне — РНИМУ им. Н.И. Пирогова). С 1980 г. — ассистент кафедры, с 1995 г. — профессор кафедры.

Основное направление научной деятельности Шалиной Р.И. — перинатология. Исследования посвящены осложнениям беременности и родов, являющихся основной причиной детской заболеваемости и смертности.

На протяжении 30 лет научные изыскания связаны с изучением этиологии и патогенеза одного из наиболее частого осложнения беременности, приводящего к детской патологии — преэклампсии.

В 1995 г. Шалина Р.И. защитила докторскую диссертацию на тему: «Гестоз. Современные аспекты патогенеза, профилактики и лечения гестоза».

Одним из новых научных изысканий Шалиной Р.И. является проблема преждевременных родов. Шалиной Р.И. внедрены новые методы ведения преждевременных родов с учётом ближайших и отдаленных результатов развития недоношенных детей.

Шалина Р.И. — автор более 150 публикаций, наиболее важные из них — «Национальное руководство по акушерству», «Справочник по акушерству, гинекологии, перинатологии». Член редакционной коллегии журнала «Акушерство, Гинекология, Перинатология», член диссертационного совета 21.2.058.08 при РНИМУ им. Н.И. Пирогова, член экспертного совета Высшей аттестационной комиссии (ВАК), член ученого совета педиатрического факультета РНИМУ им. Н.И. Пирогова.

Р.И. Шалина — куратор и руководитель более 25 диссертационных работ.

Осуществляет консультативные приемы в Центре планирования семьи и репродукции, Клиническом госпитале MD GROUP. Является врачом высшей квалификационной категории.