Используя методы высокопроизводительного секвенирования, транскриптомного и протеомного анализа, клеточной и белковой инженерии, мы работаем над выяснением базовых принципов, обеспечивающих распознавание и принятие  решений иммунной системой при взаимодействии с разными антигенами, разработкой методов характеристики антигенной специфичности клеток системы адаптивного иммунитета в норме и при патологиях, связанных с нарушением иммунологической толерантности, выяснением молекулярных и клеточных механизмов развития таких патологий и разработкой на этой основе способов целенаправленного формирования или нарушения иммунотолерантности  для эффективной терапии.