Кафедра фармакологии была создана при Московских высших женских курсах в 1906 г.

Первым ее руководителем был профессор Дмитрий Михайлович Щербачев.

Его труды до сих пор имеют большое научное значение. Среди них – «Историко-фармакологические очерки» (1910), «Курс фармакологии с рецептурой и бальнеологией для врачей» (1922), «Начальный курс фармакологии для медицинских сестер и акушерок» (1949).

В учебнике  «В курсе фармакогнозии», изданном в 1930 г в соавторстве с А.В. Могильским, впервые была приведена химическая классификация лекарственного сырья и лекарственных растений.

В 1924–1958 гг. заведующим кафедрой фармакологии был академик АМН СССР профессор Владислав Иринархович Скворцов. Свое научное мировоззрение В.И. Скворцов изложил в многочисленных статьях и монографиях. Среди них выделяется работа «Ацидоз и алкалоз в медицине», в которой даны не только блестящие научные обобщения, но и сделаны неожиданные предсказания. Кафедра уделяла большое внимание совершенствованию педагогического процесса. Еще в 1921–1922 гг. В.И. Скворцовым был написан учебник для студентов «Курс фармакологии» (8 переизданий). Эта книга считалась одной из лучших по курсу фармакологии и была переведена на румынский, грузинский, азербайджанский и другие языки.

В 30-е гг. на кафедру пришли первые аспиранты, была введена доцентура. Место первого доцента занял К.Д. Саргин (1935). В 1936 г. в составе кафедры был профессор, доцент и 5 ассистентов. С 1948 г. на кафедре готовились кадры и через докторантуру. Ее успешно закончили и защитили докторские диссертации В.В. Васильева (1954), А.А. Гаврилюк (1954), А.А. Тюрина (1959). Тематика научных исследований тех лет была посвящена изучению антитоксических, вегетотропных, химиотерапевтических средств, витаминов, гормонов, солей щелочных и щелочноземельных металлов.

В 1958–1964 гг. кафедру возглавляла профессор Валентина Васильевна Васильева. Под ее руководством в фармакологические исследования были внедрены радиоизотопные и иммунологические методы, широко изучались вещества, вызывающие зависимость, внедрялись в медицинскую практику новые антикоагулянты, было защищено 12 докторских и 30 кандидатских диссертаций, опубликовано свыше 800 работ.

Профессор В.В. Васильева уделяла внимание совершенствованию учебного процесса. Под ее редакцией было издано «Руководство к практическим занятиям по фармакологии и общей рецептуре» (1962) для студентов медицинских вузов. В.В. Васильева была постоянным представителем ООН по вопросам наркологии, ректором 2-го ММИ во время войны, заместителем главного редактора журнала «Фармакология и токсикология», членом Президиума Комитета советских женщин.

В 1964–1969 гг. кафедрой заведовал профессор Михаил Филиппович Меркулов, под руководством которого в изучение действия лекарственных веществ были внедрены методы авторадиографии, широко исследовались цитостатики, анестетики и антикоагулянты. Под руководством профессора М.Ф. Меркулова было защищено 4 докторских и 18 кандидатских диссертаций.

В 1969–1982 гг. руководителем кафедры являлся профессор Виктор Андреевич Бабичев.

Под его руководством проводились исследования механизма действия иммунодепрессантов и цитостатиков.

В 1970 г. под редакцией профессора В.А.Бабичева вышло из печати методическое пособие «Элементы программированного обучения и контроля в курсе фармакологии», а также несколько сборников научных работ, а в В 1974 г. увидела свет выпущенная им в соавторстве с Б.С. Утешевым монография «Ингибиторы биосинтеза антител», которая до сих пор широко цитируется в отечественной и зарубежной научной литературе.