Обучение в клинической ординатуре на кафедре Инфекционных болезней у детей проводится по специальности «Педиатрия». Программа обучения включает практическую и теоретическую части.

Практическая подготовка по основным направлениям педиатрии (гастроэнтерология, кардиология, неонатология и др.), инфекционной патологии (кишечные инфекции, ОРВИ, нейроинфекции и др.) и иммунопрофилактике осуществляется на основных клинических базах кафедры.